云南彝族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性

杨朔; 姜焰凌; 方宝雄; 计艾岑; 张寿勋; 张秀峰; 张柠; 赵斐; 钟树荣

云南彝族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性

杨朔¹,
姜焰凌¹,
方宝雄^1,2,
计艾岑¹,
张寿勋¹,
张秀峰^1,3,
张柠¹,
赵斐^1,4,
钟树荣^1,3

1. 昆明医科大学法医学院
2. 广西壮族自治区钦州市公安局钦南分局刑侦大队
3. 昆明医科大学司法鉴定中心

基金项目:

基金：国家自然科学基金资助项目 (81660232, 81000577); 云南省科技厅-昆明医科大学应用基础研究联合专项基金资助项目 (2015FB011); 昆明医科大学百名中青年学术技术骨干项目 (60117190413) ;昆明医科大学大学生创新性试验计划项目 (CX201416, CX201544, CX201654, 601162023);

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出版历程
- 收稿日期: 2018-09-04

Genetic Polymorphism of 19 Autosomal STR Loci in Yunnan Yi Popolation

Funds:

摘要

摘要: 目的研究云南彝族215个健康无关个体19个常染色体STR基因座的遗传多态性, 计算群体遗传学参数, 建立云南彝族群体的遗传学基础数据, 为法医物证亲权鉴定和个体识别提供科学依据。方法采用Chelex-100法提取样本DNA, Power PlexR21 System试剂盒进行扩增, ABI 3130XL自动遗传分析仪对PCR复合扩增产物进行分析, 用ABI的Gene Mapper v3.2软件进行STR基因分型分析, 用Modified-Powerstates软件进行法医学遗传学参数统计分析以及Hardy-Weinberg平衡检验。结果共检出203个等位基因和666种基因型。除D1S1656、D5S818、D12S391外, 基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡规律 (P> 0.05) , 累积非父排除率 (CPE) 为0.999 999 907, 累积个人识别能力 (TDP) 为0.999 999 999 999 999 999 999 9。结论 19个常染色体基因座在云南彝族人群中具有较高的多态性和较好的个体识别能力, 能够为法医学个体识别和亲权鉴定提供科学的遗传学基础数据。
- STR /
- 云南彝族 /
- 遗传多态性
Abstract: Objective To study the genetic polymorphisms of 19 autosomal STR loci in 215 healthy unrelated individuals of Yunnan Yi population, calculate population genetic parameters, and establish genetic basis data of Yunnan Yi population, and provide scientific basis for forensic material identification and individual identification.Methods The sample DNA was extracted by Chelex-100 method, amplified by Power Plex 21 System kit, and the PCR composite amplification product was analyzed by ABI 3130 XL automatic genetic analyzer. STR was performed with ABI Gene Mapper v3.2 software. Genotyping analysis, statistical analysis of forensic genetic parameters and Hardy-Weinberg equilibrium test using Modified-Powerstates software. Results A total of 203 alleles and 666 genotypes were detected. Except D1 S1656, D5 S818, D12 S391, the genotype distribution accorded with Hardy-Weinberg equilibrium law (P > 0.05) , the cumulative non-parent exclusion rate (CPE) was 0.999 999 907, and the cumulative personal recognition ability (TDP) was 0.999 999 999 999 999. 999 9999. Conclusion The 19 autosomal loci have high polymorphism and good individual recognition ability in Yunnan Yi population, and can provide scientific genetic basic data for forensic individual identification and paternity identification.
- STR /
- Yunnan Yi population /
- Genetic polymorphism

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参考文献(16)

[1]	[1]WIEGANDP, KLEIBER M. Less is more-length reduction of STR amplicons using redesigned primers[J].International Journal of Legal Medicine, 2001, 114 (4-5) :285-287.
[2]	[2]WHITAKER J P, CLAYTON T M, URQUHART A J, et al. Short tandem repeat typing of bodies from a mass disaster:high success rate and characteristic amplification patterns in highly degraded samples[J].Biotechniques, 1995, 18 (4) :670-677.
[3] 侯一平.STR自动分型[M].法医物证学第3版.北京:人民卫生出版社, 2013:127.
[4]	[4]BUTLER J M, COBLE M D, VALLONE P M. STRs vs.SNPs:thoughts on the future of forensic DNA testing[J].Forensic science, medicine and pathology, 2007, 3 (3) :200-205.
[5]	[5]TONG D, CHEN Y, OU X, et al. Polymorphism analysis and evaluation of 19 STR loci in the Han population of Southern China[J].Annals of Human Biology, 2013, 40 (2) :191-196.
[6]刘开会, 李兆隆, 常彩琴.用Chelex100法及有机溶剂提取法联合提取DNA扩增STR基因座的比较研究[J].中国法医学杂志, 2001, 16 (2) :84-86.
[7]赵方, 伍新尧, 蔡贵庆, et al. Modified-Powerstates软件在法医生物统计中应用[J].中国法医学杂志, 2003, 18 (5) :297-298.
[8]侯一平.法医DNA分析的科学证据意义[J].中国法医学杂志, 2001, 16 (2) :118-126.
[9]	[9]THOMPSON G E A.Performingthe Exact Test of HardyWeinberg Proportion for Multiple Alleles[J].Biometrics, 1992, 48 (2) :361-372.
[10]	[10]LIU J, GUO L, QI R, et al. Allele frequencies of 19 autosomal STR loci in Manchu population of China with phylogenetic structure among worldwide populations[J].Gene, 2013, 529 (2) :282-287.
[11]胡利平, 杜雷, 张秀峰, 等.云南汉族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性[J].昆明医科大学学报, 2016, 37 (5) :17-21.
[12]	[12]GILL P, URQUHART A, MILLICAN E S, et al. A new method of STR interpretation using inferential logic-Development of a criminal intelligence database[J].International Journal of Legal Medicine, 1996, 109 (1) :14-22.
[13]李忠杰, 吴虎, 吴海军, 等.苏州地区凉山籍彝族人群17个STR基因座遗传多态性[J].中国法医学杂志, 2015, 30 (4) :407-408.
[14]陈丹, 白小刚, 李庆庆, 等.四川彝族人群15个常染色体STR基因座遗传多态性[J].中国法医学杂志, 2012, 27 (6) :480-481.
[15]甘孜藏族自治州彝族人群18个STR基因座的遗传多态性研究[J].刑事技术, 2017, 42 (3) :191-194.
[16]刘程静, 郑和成, 许建明, 等.云南地区彝族人群17个STR基因座的遗传多态性[J].中国法医学杂志, 2016, 31 (5) :493-494.

相关文章(20)

[1]	石妍, 江坚, 陈冲, 张京晶, 贾莉, 高知枭, 李惠芬, 严江伟, 任贺. Microreader^TM 23HS Plex ID System中23个常染色体STR基因座在中国北方汉族人群中多态性调查, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240723
[2]	赵凯, 张韵梅, 王伟涛, 李光兴. 17个常染色体STR基因座在基诺族人群的遗传多态性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230627
[3]	徐冲冲, 王上, 魏巍, 张柠, 黎宽, 连心情, 王诗旭, 周雪梅, 卢晓筱, 钟树荣. 文山红河地区苗族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20221020
[4]	魏巍, 张寿勋, 徐冲冲, 姜焰凌, 李屹, 杨朔, 韩建利, 黎宽, 赵斐, 杨晓佩, 张柠, 卢晓筱, 钟树荣. 云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220510
[5]	聂爱婷, 计艾岑, 胡利平, 张秀峰, 刘林林, 李佳珏, 聂胜洁. 云南汉族、彝族躯体攻击行为与MAOA μ-VNTR多态性的关联性分析, 昆明医科大学学报.
[6]	刘钧, 许冰莹. Expressmarker16+10Y试剂盒一致性评价及在DNA数据库建设中的应用, 昆明医科大学学报.
[7]	陈灿昆, 陈志彬, 杨靖宜, 杨钰, 范志祥, 张延洁, 张璐, 龙莉. CBS基因844ins68多态性在云南彝族中的分布, 昆明医科大学学报.
[8]	庞敬博, 李佳珏, 刘灿刚, 刘浩东, 吴波, 聂胜洁, 胡利平. 曲靖汉族人群19个STR基因座遗传多态性分析, 昆明医科大学学报.
[9]	张柠, 姜焰凌, 方宝雄, 计艾岑, 张秀峰, 张寿勋, 杨朔, 赵斐, 钟树荣. 云南苗族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[10]	杨朔, 卢晓筱, 张寿勋, 夏生, 张柠, 张秀峰, 李佳珏, 胡利平, 钟树荣. 云南壮族、傣族、哈尼族20个常染色体STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[11]	雷强, 肖月, 张微, 翟滇, 程宝文, 曾发明. 云南巍山回族27个Y-STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[12]	陈国文. MCP-1 G-2518A多态性在云南彝族人群中的分布, 昆明医科大学学报.
[13]	罗兰. 云南彝族男性AT1R A1166C、AGT M235T多态性及血生化指标与原发性高血压的相关性, 昆明医科大学学报.
[14]	唐维. 云南白族15个常染色体STR 基因座的遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[15]	胡利平. 云南汉族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[16]	马立宇. 云南白族人群13个快速突变（RM）Y-STR基因座多态性研究, 昆明医科大学学报.
[17]	余建华. 云南汉族人群15个常染色体STR基因座的遗传多态性与OL等位基因的研究, 昆明医科大学学报.
[18]	龙莉. 血管紧张素原基因M235T多态性在云南彝族人群中的分布, 昆明医科大学学报.
[19]	杨榆玲. 血管紧张素II 1型受体A1166C多态性在云南彝族人群中的分布, 昆明医科大学学报.
[20]	刘德华. 昆明地区汉族人群9个Y-STRs基因座遗传多态性及法医学应用研究, 昆明医科大学学报.

施引文献

期刊类型引用(9)

1.	孙美娜，董美娟，黄巧云，李伟明，袁丹，李亚丽，自蓉. 云南省住院医师规范化培训公共理论培训满意度现状及影响因素分析. 中华全科医学. 2022(02): 320-323 . 百度学术
2.	夏薇凌，杨帆，李丽梅，钟漓. 住院医师规培政策与职业生涯规划的相关性. 中国继续医学教育. 2021(19): 70-73 . 百度学术
3.	张艳梅，袁丹，自蓉，黄巧云，董美娟，李亚丽，刘莹钰睿，李伟明. 住院医师规范化培训学员的培训意愿及其影响因素研究. 卫生软科学. 2021(10): 74-76+92 . 百度学术
4.	阿拉腾楚鲁，高玉梅. 住院医师规范化培训政策对医学生职业规划的影响. 中国继续医学教育. 2020(08): 35-37 . 百度学术
5.	李丽，潘黎. 临床医学专业本科生对住院医师规范化培训的认知和意愿调查. 现代医院管理. 2019(01): 69-73 . 百度学术
6.	解俊杰. 住院医师规范化培训经费投入的调查与分析. 中国卫生标准管理. 2019(04): 23-25 . 百度学术
7.	周愉，刘云飞，管映虹，郭振川，宫毅，马建国. 宫毅治痔临证经验与诊治指南相结合的规范化培训研究. 中国中医药现代远程教育. 2018(12): 39-41 . 百度学术
8.	程华俊. 急诊医学科住院医师的规范化培训管理. 中医药管理杂志. 2018(20): 42-43 . 百度学术
9.	林锋. 精神科住院医师规范化培训师资队伍绩效考核体系的探索与实践. 中医药管理杂志. 2018(22): 125-126 . 百度学术