基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因

马国玉; 熊庆; 蒋国庆; 杨家甜; 木云珍

基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因

1. 昆明医科大学公共卫生学院
2. 云南省疾病预防控制中心环境卫生所
3. 昆明医科大学第一附属医院产科

基金项目:

昆明医科大学科技创新团队基金资助项目(CXTD201706)；

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摘要

摘要: 目的利用生物信息学方法筛查肺腺癌的差异基因,分析其在肺腺癌的发生发展过程中可能参与的信号传导通路,寻找肺腺癌的关键基因并评估其对肺腺癌预后的意义。方法从GEO数据库中获取肺腺癌基因表达芯片数据集GSE10072、GSE32863、GSE43458和GSE116959,将四组数据集整合后获得肺腺癌的差异表达基因,采用STRING数据库对差异表达基因构建肺腺癌蛋白-蛋白互相作用网络,通过在线网站DAVID对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,用Cytohubba筛选关键基因,并利用GEPIA分析关键基因与预后的相关性。结果初步筛查得到214个差异基因,包括42个上调基因和172个下调基因,最后筛选得到6个关键基因。生存分析显示PECAM1、SPP1和KIAA0101的表达对肺腺癌的预后有显著影响(P<0.05),Diseasemeth分析显示SPP1、KIAA0101、COL3A1、GNG11和FOS基因在肺腺癌组织中的甲基化水平异常(P<0.05)。结论这6个基因可能参与了肺腺癌的发生发展,对肺腺癌的诊断、靶点治疗和预后提供一定参考。
- 生物信息学 /
- 肺腺癌 /
- 基因 /
- 生存分析 /
- 预后

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[15]	吴琪燕, 边革元, 程绘珺, 李娇霞, 王书廷, 黄照略. 肺腺癌预后因素及血清肿瘤标记物的诊断效能, 昆明医科大学学报.
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