基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因

马国玉; 熊庆; 蒋国庆; 杨家甜; 木云珍

基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因

1. 昆明医科大学公共卫生学院
2. 云南省疾病预防控制中心环境卫生所
3. 昆明医科大学第一附属医院产科

基金项目:

昆明医科大学科技创新团队基金资助项目(CXTD201706)；

计量
- 文章访问数: 3457
- HTML全文浏览量: 1337
- PDF下载量: 122
- 被引次数: 0
出版历程

摘要

摘要: 目的利用生物信息学方法筛查肺腺癌的差异基因,分析其在肺腺癌的发生发展过程中可能参与的信号传导通路,寻找肺腺癌的关键基因并评估其对肺腺癌预后的意义。方法从GEO数据库中获取肺腺癌基因表达芯片数据集GSE10072、GSE32863、GSE43458和GSE116959,将四组数据集整合后获得肺腺癌的差异表达基因,采用STRING数据库对差异表达基因构建肺腺癌蛋白-蛋白互相作用网络,通过在线网站DAVID对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,用Cytohubba筛选关键基因,并利用GEPIA分析关键基因与预后的相关性。结果初步筛查得到214个差异基因,包括42个上调基因和172个下调基因,最后筛选得到6个关键基因。生存分析显示PECAM1、SPP1和KIAA0101的表达对肺腺癌的预后有显著影响(P<0.05),Diseasemeth分析显示SPP1、KIAA0101、COL3A1、GNG11和FOS基因在肺腺癌组织中的甲基化水平异常(P<0.05)。结论这6个基因可能参与了肺腺癌的发生发展,对肺腺癌的诊断、靶点治疗和预后提供一定参考。
- 生物信息学 /
- 肺腺癌 /
- 基因 /
- 生存分析 /
- 预后

HTML全文

参考文献(0)

相关文章(20)

[1]	马彬斌, 张少雄, 高永丽. 基于生物信息学探究ESCRT相关基因对骨肉瘤预后的评估价值, 昆明医科大学学报.
[2]	聂琪, 刘莉, 田玥, 毛晓燕, 郭渠莲, 田新. 儿童急性B淋巴细胞白血病ACTH异常临床特征与预后分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20241012
[3]	艾中华, 黄友, 朱翔龙, 高艳春, 唐松源, 潘瑞. 云南省0～5岁儿童母乳喂养持续时间及影响因素分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240215
[4]	赵冬艳, 杨润许. 双相情感障碍的遗传学研究进展, 昆明医科大学学报.
[5]	周海, 袁中琴, 岑泳村, 陆彦霓, 姚志红, 周永春, 黄云超. 1635例食管癌患者生存分析的单中心回顾性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240810
[6]	杨红秀, 朱中山. 肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
[7]	安义均, 余立丹, 赵美素, 马冬梅, 杨春花, 孔瑶. 膀胱癌溶酶体相关基因的预后模型构建与分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240510
[8]	赵丽珠, 董莹, 邓玥, 杨丽华. 基于单细胞测序技术分析上皮细胞相关基因与卵巢癌患者预后的关系, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240402
[9]	唐嘉黛, 杨静, 宋红莉, 陈娇娇, 缪忠惠, 谢琳. 318例原发性胃癌转移及预后影响因素的相关分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230218
[10]	陆小华, 袁洪新. BTLA、CTLA-4基因多态性与肝癌TACE联合靶向治疗疗效及预后相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230927
[11]	高婷, 黄胜, 郭瑢, 陈德滇. 乳腺粘液腺癌的临床病理特征及预后分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230306
[12]	朱一珂, 杨君素, 钱芳, 吴昊昊, 黄保岗. 急性缺血性脑卒中患者血运重建前后NLR值与预后相关性分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220815
[13]	胡昌猛, 吴琳. Silva分型与宫颈HPV相关腺癌预后的相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220817
[14]	朱中山, 杨洲, 江承川, 李小兵, 任斗, 黄橙, 张维薇, 李湘军, 赵顺利. 肺腺癌患者PLA2G1B表达情况与预后的相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220912
[15]	吴琪燕, 边革元, 程绘珺, 李娇霞, 王书廷, 黄照略. 肺腺癌预后因素及血清肿瘤标记物的诊断效能, 昆明医科大学学报.
[16]	朱中山, 严文辉, 李小兵, 杨洲, 白鹏. 200例肺腺癌脑转移患者驱动基因突变情况及预后关系, 昆明医科大学学报.
[17]	陈波. hsa-miR-126的靶基因预测及功能分析, 昆明医科大学学报.
[18]	石磊. 31例脑胶质瘤临床预后及其影响因素分析, 昆明医科大学学报.
[19]	孙健玮. PTEN基因与前列腺癌, 昆明医科大学学报.
[20]	刘梅. 2007年至2008年昆明地区腹泻患儿轮状病毒非结构蛋白基因特征的分析, 昆明医科大学学报.