Association of ABCG2，SLC2A9，SLC17A3 and PRKG2 SNPs Variants with Gout in the Hani Population in China
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摘要:
目的 探讨哈尼族和汉族人群ABCG2、SLC2A9、SLC17A3和PRKG2基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），研究这四个基因上的五个SNP位点（rs2231142、rs6855911、rs1014290、s1165205和rs7688672）在哈尼族和汉族痛风人群中的遗传特征和遗传机制。 方法 选取100例哈尼族痛风患者、126例哈尼族健康对照者、100例哈尼族痛风患者、108例汉族健康对照者，利用PCR扩增测序结合SNaPshot多重分析技术对五个SNP位点进基因分型，采用统计软件SPSS20.0进行分析。 结果 在哈尼族人群中，rs2231142位点的基因型频率（P = 0.002）和等位基因频率（P = 0.024）与高尿酸血症显著相关。在汉族人群中，rs7688672位点的基因型频率（P = 0.018）和等位基因频率（P = 0.034）；rs1165205位点的基因型频率（P = 0.037）与高尿酸血症显著相关。 结论 ABCG2基因中rs2231142位点、SLC17A3基因中rs1165205位点和PRKG2基因中rs7688672位点与痛风发病显著相关，为痛风和高尿酸血症的筛查、诊断和治疗提供了潜在的靶点。 Abstract:Objective To analyze the genetic characteristics and genetic mechanisms in the Hani and Han population by studying the association of five single nucleotide polymorphisms （SNPs） in four gene with gout. Methods A total of 100 Hani gout group, 126 Hani normal control group, 100 Hani gout group, 108 Han normal control group were enrolled in this study. Genotyping of the ABCG2, SLC2A9, SLC17A3 and PRKG2 was determined by cloning and sequencing of PCR amplicons and SNaPshot. SPSS version 20.0 was used for statistical calculations. Results The results showed that the genotype （P = 0.002） and allele （P = 0.024） frequency at the rs2231142 site was significantly associated with Hyperuricemia in Hani populations. In the Han populations, the genotype （P = 0.018） and allele （P = 0.034） frequency at the rs7688672 site was significantly associated with Hyperuricemia. In addition, the genotype frequency at the rs1165205 site was significantly associated with Hyperuricemia in Han populations （P = 0.037）. Conclusion ABCG2 rs2231142, SLC17A3 rs1165205 and PRKG2 rs7688672 polymorphisms are able to affect the risk of gout, which provides a potential candidate biomarker for screening, diagnosis, and treatment of gout and Hyperuricemia. -
Key words:
- Gout /
- Hyperuricemia /
- SNPs /
- Hani population
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表 1 引物序列
Table 1. Primer sequences
位点 引物序列 rs2231142-F CTGCAGGTTCATCATTAGCTAGAAC rs2231142-R TTCATGATTCGTCATAGTTGTTGC rs6855911-F TCCCACACTAGCATATAAGAGGAAC rs6855911-R GTGGTCAAGAAAGTGTCCAGCTAC rs1014290-F AATGATACAATGCATTATCAGCTCC rs1014290-R GATGATGAAGTTTCCAGACCTCAG rs1165205-F TGCTAATGGAAACATCATATTCTTG rs1165205-R CATGTGCTTTCATTTCTCTCAGATA rs7688672-F ACTATGACTTTTCTGACAATGGCC rs7688672-R TCCAGAGTGGCTTTAATTGAACAT 
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表 2 汉族和哈尼族痛风组和非痛风组的个人基本资料和临床生化指标测定比较（mean±SE）
Table 2. The clinical features of subjects with gout and non-gout from 226 Hani populations and 208 Han populations in China （mean ± SE）
民族
指标哈尼族 汉族 痛风组 （n = 100） 对照组 （n = 126） 痛风组 （n = 100） 对照组 （n = 108） 性别 男/女（n） 78/22 84/42 78/22 69/39 P 0.035 ALT（U/L） 41.17 ± 7.97 27.83 ± 1.97 37.92 ± 4.02 29.14 ± 1.79 F 16.37 3.931 1.211 5.044 P 0.028* 0.612 0.825 0.162 AST（U/L） 43.82 ± 10.94 27.13 ± 1.06 33.56 ± 5.19 26.42 ± 1.04 F 106.5 4.443 1.039 24.90 P 0.034* 0.215 0.927 0.378 BUM（mmol/L） 7.91 ± 1.03 5.91 ± 0.15 6.45 ± 0.41 5.85 ± 0.51 F 47.15 0.0459 11.56 1.547 P 0.013* 6.311 0.941 0.472 CREA（μmol/L） 109.73 ± 9.75 76.00 ± 5.42 112.64 ± 11.93 82.93 ± 4.36 F 3.236 0.0459 1.545 7.487 P 0.005* 0.818 0.555 0.017* UA，（μmol/L） 489.11 ± 9.53 303.99 ± 5.46 523.60 ± 36.98 304.63 ± 7.02 F 3.046 15.06 1.653 27.75 P 0.0002* 0.199 0.980 0.0002* TC（mmol/L） 5.18 ± 0.12 5.14 ± 0.09 5.00 ± 0.10 5.38 ± 0.13 F 1.778 1.440 2.086 1.690 P 0.783 0.247 0.109 0.015* TG（mmol/L） 2.60 ± 0.25 1.78 ± 0.12 2.49 ± 0.18 2.18 ± 0.20 F 4.340 1.929 2.778 1.235 P 0.001* 0.680 0.099 0.258 HDL-C，（mmol/L） 1.25 ± 0.04 1.54 ± 0.04 1.24 ± 0.03 1.47 ± 0.05 F 1.000 1.778 1.563 2.778 P < 0.0002* 0.896 0.213 < 0.0002* LDL-C，（mmol/L） 2.77 ± 0.09 2.82 ± 0.08 2.79 ± 0.10 3.25 ± 0.10 F 1.266 1.235 1.563 1.000 P 0.699 0.927 0.001* 0.001* 注：*P < 0.05。
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表 3 哈尼族和汉族5个SNPs基因不同位点基因型及等位基因频率比较[n（%）]
Table 3. Genotype frequencies of five SNPs in Hani populations and Han population [n（%）]
基因型 哈尼族（n = 226） 汉族（n = 208） χ2 P 次要等位基因频率 rs2231142 0.119409 GG 99（48.1） 107（51.9） 3.24 0.198 GT 106（56.7） 81（43.3） TT 18（47.4） 20（52.6） G 205（52.2） 188（47.8） 0.319 0.613 T 18（47.4） 20（52.6） rs6855911 0.302915 A 214（52.8） 191（47.2） 3.25 0.104 G 9（34.6） 17（65.4） rs1014290 0.32528 AA 97（58.8） 68（41.2） 9.586 0.008* AG 89（43.8） 114（56.2） GG 37（58.7） 26（41.3） A 97（58.8） 68（41.2） 5.318 0.023* G 126（47.4） 140（52.6） rs1165205 0.30611 AA 148（53.2） 130（46.8） 0.707 0.702 AT 70（49.0） 73（51.0） TT 5（50.0） 5（50.0） A 218（51.8） 203（48.2） 0.012 0.911 T 5（50.0） 5（50.0） rs7688672 0.490216 AA 76（54.7） 63（45.3） 2.58 0.275 AG 110（52.9） 98（47.1） GG 37（44.0） 47（56.0） A 76（54.7） 63（45.3） 0.708 0.411 G 147（50.3） 145（49.7） 注：*P < 0.05。
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表 4 高尿酸血症组和对照组中ABCG2 （rs2231142），SLC2A9 （rs6855911 和rs1014290），SLC17A3 （rs1165205） 和 PRKG2（rs7688672）基因型频率比较[n（%）]
Table 4. Genotype frequencies and associations tests of ABCG2 （rs2231142），SLC2A9 （rs6855911 and rs1014290），SLC17A3 （rs1165205） and PRKG2（rs7688672） in Hyperuricemia patients and non-Hyperuricemia subjects [n（%）]
基因型 哈尼族 汉族 高尿酸血症组
（n = 100）对照组
（n = 126）χ2 P 高尿酸血症组
（n = 100）对照组
（n = 108）χ2 P rs2231142 GG 33（33.3） 66（66.7） 12.352 0.002* 44（41.1） 63（58.9） 5.182 0.075 GT 54（50.9） 52（49.1） 43（53.1） 38（46.9） TT 13（72.2） 5（27.8） 13（65.0） 7（35.0） G 87（42.4） 118（57.6） 5.934 0.024* 87（46.3） 101（53.7） 2.539 0.157 T 13（72.2） 5（27.8） 13（65.0） 7（35.0） rs6855911 A 95（44.4） 119（55.6） 0.435 0.519 94（49.2） 97（50.8） 1.212 0.318 G 5（55.6） 4（44.4） 6（35.3） 11（64.7） rs1014290 AA 50（51.5） 47（48.5） 3.191 0.203 36（52.9） 32（47.1） 1.803 0.406 AG 36（40.4） 53（59.6） 50（43.9） 64（56.1） GG 14（37.8） 23（62.2） 14（53.8） 12（46.2） A 50（51.5） 47（48.5） 3.119 0.08 36（52.9） 32（47.1） 0.958 0.376 G 50（39.7） 76（60.3） 64（45.7） 76（54.3） rs1165205 AA 69（46.6） 79（53.4） 1.317 0.517 71（54.6） 59（45.4） 6.569 0.037* AT 28（40.0） 42（60.0） 28（38.4） 45（61.6） TT 3（60.0） 2（40.0） 1（20.0） 4（80.0） A 97（44.5） 121（55.5） 0.475 0.659 99（48.8） 104（51.2） 1.618 0.371 T 3（60.0） 2（40.0） 1（20.0） 4（80.0） rs7688672 AA 32（42.1） 44（57.9） 0.531 0.767 23（36.5） 40（63.5） 8.051 0.018* AG 52（47.3） 58（52.7） 47（48.0） 51（52.0） GG 16（43.2） 21（56.8） 30（63.8） 17（36.2） A 32（42.1） 44（57.9） 0.349 0.573 23（36.5） 40（63.5） 4.845 0.034* G 68（46.3） 79（53.7） 77（53.1） 68（46.9） 注：*P < 0.05。
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