云南汉族人群<i>mircoRNA-149、mircoRNA-219、mircoRNA-let-7</i>基因多态性与非小细胞肺癌发生和发展的相关性

杨佳; 李娅娴; 王莹莹; 肖琳; 李传印; 谭芳; 马千里; 刘舒媛

doi:10.12259/j.issn.2095-610X.S20211037

云南汉族人群mircoRNA-149、mircoRNA-219、mircoRNA-let-7基因多态性与非小细胞肺癌发生和发展的相关性

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20211037

1.
中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所，云南省重大传染病疫苗研发重点实验室，云南昆明　650118
2.
昆明医科大学第一附属医院干部医疗科，云南昆明　650032
3.
昆明医科大学第三附属医院胸外科，云南昆明　650118

基金项目: 国家自然科学基金资助项目（81573206）；云南省应用基础研究计划-昆明医科大学联合专项基金资助项目（2018FE001-219，202001AY070001081）；北京协和医学院中央高校基本科研业务费资助项目（3332019111）；云南省医学后备人才项目（H-2018014）

详细信息

作者简介:
杨佳（1985～），女，云南大理人，理学学士，主管技师，主要从事免疫遗传学研究

通讯作者:
刘舒媛，E-mail: liushuyuan@imbcams.com.cn

中图分类号: R734.2
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出版历程
- 收稿日期: 2021-08-08
- 网络出版日期: 2021-10-29
- 刊出日期: 2021-10-30

Association of the miR-149,miR-219 and miR-let-7 Polymorphisms with the Occurrence and Development of Non-small Cell Lung Cancer in a Chinese Han Population in Yunnan Province

1.
Dept. of Immunogenetics，Institute of Medical Biology，Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College，Kunming Yunnan 650118
2.
The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University，Kunming Yunnan 650032
3.
The Third Affiliated Hospital of Kunming Medical University，Kunming Yunnan 650118，China

摘要

摘要: 目的探讨mircoRNA基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌发生发展的相关性。方法选取云南地区汉族人群非小细胞肺癌患者415例，健康对照460例，采用Taqman探针基因分型法对3个SNP位点rs2292832 T>C (pre-miR-149)、rs107822 C>T(pre-miR-219a-1)，rs629367 C>A (pri-let-7a-1)进行基因分型并分析其等位基因、基因型在非小细胞肺癌患者(按病理分层为鳞癌、腺癌及其他类型肺癌；按临床分期分层为I+II期、III+IV期)及健康对照中的频率差异。结果 rs2292832、rs107822、rs629367位点的等位基因、基因型频率在非小细胞肺癌组和对照组间的差异没有统计学意义，在分层分析及遗传模式分析中也无显著性差异。结论 rs2292832、rs107822、rs629367可能与云南汉族人群非小细胞肺癌无相关性。
- 非小细胞肺癌 /
- miRNA /
- SNPs /
- 相关性 /
- 云南汉族人群
Abstract: Objectives To investigate the relationship between mircoRNA gene polymorphisms and the occurrence and development of non-small cell lung cancer in Yunnan Han population. Methods A total of 415 lung cancer patients of non-small cell lung cancer and 460 healthy individuals were included from Yunnan Han population. The genotypes of 3 polymorphism loci, rs2292832 T>C（pre-miR-149）, rs107822 C>T（pre-miR- 219a-1）, rs629367 C>A（pri-let-7a-1）were detected by TaqmanSNP genotyping assay. The distribution of allele and genotype frequency in lung cancer patients and healthy controls were analyzed. Results There was no significant difference of the allele and genotype frequency of 3 SNPs. And in stratification analysis, there was also no significant difference. Conclusions rs2292832, rs107822, rs629367 may not be significantly associated with non-small cell lung cancer in Yunnan Han population.
- Non-small cell lung cancer /
- miRNA /
- SNPs /
- Association /
- Yunnan Han population

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表 1 3个miRNA的SNP位点在总肺癌病例组和对照组的等位基因和基因型频率[n（%）]

Table 1. Allele and genotype frequencies of three SNPs in miRNA between total lung cancer case group and control group [n（%）]

SNPs	等位基因/基因型	对照组（n = 460）	总肺癌病例（n = 415）	P	OR（95%CI）
rs2292832	T	589（64.0）	563（67.8）	0.093	0.84（0.69～1.03）
	C	331（36.0）	267（32.2）	0.093	0.84（0.69～1.03）
	T/T	193（42.0）	197（47.5）	0.243
	T/C	203（44.1）	169（40.7）
	C/C	64（13.9）	49（11.8）
rs107822	T	534（58.0）	475（57.2）	0.731	1.03（0.86～1.25）
	C	386（42.0）	355（42.8）	0.731	1.03（0.86～1.25）
	T/T	162（35.2）	145（34.9）	0.877
	T/C	210（45.7）	185（44.6）
	C/C	88（19.1）	85（20.5）
rs629367	A	709（77.1）	643（77.5）	0.840	1.02（0.82～1.28）
	C	211（22.9）	187（22.5）	0.840	1.02（0.82～1.28）
	A/A	277（60.2）	254（61.2）	0.934
	A/C	155（0.337）	135（0.325）
	C/C	28（0.061）	26（0.063）

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表 2 分层分析3个miRNA的SNP位点在肺癌病例和对照组中的等位基因和基因型频率差异[n（%）]（1）

Table 2. The allele and genotype frequency of three SNPs in lung cancer group and control group by stritification analysis [n（%）] （1）

SNPs	等位基因/基因型	对照组	鳞癌病例	腺癌病例	Ⅰ+Ⅱ期病例	Ⅲ+Ⅳ期病例
SNPs	等位基因/基因型	（n = 460）	（n = 150）	（n = 241）	（n = 134）	（n = 281）
rs2292832	T	589（64.0）	203（67.7）	320（66.4）	181（67.5）	382（0.680）
	C	331（36.0）	97（32.3）	162（33.6）	87（32.5）	180（32.0）
	T/T	193（42.0）	70（46.7）	110（45.6）	64（47.8）	133（47.3）
	T/C	203（44.1）	63（42.0）	100（41.5）	53（39.6）	116（41.3）
	C/C	64（13.9）	17（11.3）	31（12.9）	17（12.7）	32（11.4）
rs107822	T	534（58.0）	169（56.3）	274（56.8）	140（52.2）	335（59.6）
	C	386（42.0）	131（43.7）	208（43.2）	128（47.8）	227（40.4）
	T/T	162（35.2）	50（33.3）	86（35.7）	38（28.4）	107（38.1）
	T/C	210（45.7）	69（46.0）	102（42.3）	64（47.8）	121（43.1）
	C/C	88（19.1）	31（20.7）	53（22.0）	32（23.9）	53（18.9）
rs629367	A	709（77.1）	232（77.3）	376（78.0）	213（79.5）	430（76.5）
	C	211（22.9）	68（22.7）	106（22.0）	55（20.5）	132（23.5）
	A/A	277（60.2）	92（61.3）	150（62.2）	83（61.9）	171（60.9）
	A/C	155（33.7）	48（32.0）	76（31.5）	47（35.1）	88（31.3）
	C/C	28（6.1）	10（6.7）	15（6.2）	4（3.0）	22（7.8）

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表 2 分层分析3个miRNA的SNP位点在肺癌病例和对照组中的等位基因和基因型频率差异[n（%）] （2）

Table 2. The allele and genotype frequency of three SNPs in lung cancer group and control group by stritification analysis [n（%）] （2）

鳞癌病例vs对照组		腺癌病例vs对照组		Ⅰ+Ⅱ期病例vs对照组		Ⅲ+Ⅳ期病例vs对照组
P	OR（95%CI）	P	OR（95%CI）	P	OR（95%CI）	P	OR（95%CI）
0.251	0.85（0.64～1.12）	0.378	0.90（0.71～1.14）	0.289	0.86（0.64～1.14）	0.121	0.84（0.67～1.05）
0.531		0.644		0.490		0.311
0.603	1.07（0.82～1.40）	0.667	1.05（0.84～1.31）	0.091	1.26（0.96～1.66）	0.553	0.94（0.76～1.16）
0.923	1.02（0.74～1.39）	0.688	1.06（0.81～1.38）	0.404	1.15（0.83～1.61）	0.807	0.97（0.76～1.24）
0.913		0.846		0.375		0.578

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表 3 3个SNP位点在不同遗传模式下与肺癌的相关性[n（%）]

Table 3. Iheritance model analysis of the association between lung cancer andthese 3 SNPs [n（%）]

SNPs	遗传模式	基因型	对照组（n = 460）	总肺癌病例组（n = 415）	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs2292832	共显性模式	T/T	193 （42.0）	197 （47.5）	1	0.243	1215.7	1239.6
		T/C	203 （44.1）	169 （40.7）	0.81 （0.61～1.08）
		C/C	64 （13.9）	49 （11.8）	0.75 （0.49～1.15）
	显性模式	T/T	193 （42）	197 （47.5）	1	0.101	1213.8	1232.9
	显性模式	T/C-C/C	267 （58.0）	218 （52.5）	0.80 （0.61～1.04）	0.101	1213.8	1232.9
	隐性模式	T/T-T/C	396 （86.1）	366 （88.2）	1	0.354	1215.8	1234.9
	隐性模式	C/C	64 （13.9）	49 （11.8）	0.83 （0.56～1.24）	0.354	1215.8	1234.9
	超显性模式	T/T-C/C	257 （55.9）	246 （59.3）	1	0.309	1215.5	1234.6
	超显性模式	T/C	203 （44.1）	169 （40.7）	0.87 （0.66～1.13）	0.309	1215.5	1234.6
	逻辑加性模式	---	---	---	0.85 （0.70～1.03）	0.100	1213.9	1233
rs107822	共显性模式	T/T	162 （35.2）	145 （34.9）	1	0.877	1218.3	1242.2
		C/T	210 （45.6）	185 （44.6）	1.00 （0.74～1.35）
		C/C	88 （19.1）	85 （20.5）	1.09 （0.75～1.59）
	显性模式	T/T	162 （35.2）	145 （34.9）	1	0.932	1216.5	1235.6
	显性模式	C/T-C/C	298 （64.8）	270 （65.1）	1.03 （0.78～1.36）	0.932	1216.5	1235.6
	隐性模式	T/T-C/T	372 （80.9）	330 （79.5）	1	0.671	1216.3	1235.4
	隐性模式	C/C	88 （19.1	85 （20.5）	1.09 （0.78～1.53）	0.671	1216.3	1235.4
	超显性模式	T/T-C/C	250 （54.4）	230 （55.4）	1	0.750	1216.5	1235.6
	超显性模式	C/T	210 （45.6）	185 （44.6）	0.97 （0.74～1.27）	0.750	1216.5	1235.6
	逻辑加性模式	---	---	---	1.04 （0.87～1.25）	0.680	1216.4	1235.5
rs629367	共显性模式	A/A	277 （60.2）	254 （61.2）	1	0.943	1218.5	1242.3
		A/C	155 （33.7）	135 （32.5）	0.96 （0.72～1.28）
		C/C	28 （6.1）	26 （6.3）	1.01 （0.58～1.77）
	显性模式	A/A	277 （60.2）	254 （61.2）	1	0.765	1216.5	1235.6
	显性模式	A/C-C/C	183 （39.8）	161 （38.8）	0.97 （0.74～1.27）	0.765	1216.5	1235.6
	隐性模式	A/A-A/C	432 （93.9）	389 （93.7）	1	0.913	1216.6	1235.7
	隐性模式	C/C	28 （6.1）	26 （6.3）	1.02 （0.59～1.78）	0.913	1216.6	1235.7
	超显性模式	A/A-C/C	305 （66.3）	280 （67.5）	1	0.715	1216.5	1235.6
	超显性模式	A/C	155 （33.7）	135 （32.5）	0.96 （0.72～1.27）	0.715	1216.5	1235.6
	逻辑加性模式	---	---	---	0.98 （0.79～1.22）	0.870	1216.5	1235.6

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参考文献(24)

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云南汉族人群mircoRNA-149、mircoRNA-219、mircoRNA-let-7基因多态性与非小细胞肺癌发生和发展的相关性

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20211037

作者简介:
杨佳（1985～），女，云南大理人，理学学士，主管技师，主要从事免疫遗传学研究

通讯作者:
刘舒媛，E-mail: liushuyuan@imbcams.com.cn

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Association of the miR-149,miR-219 and miR-let-7 Polymorphisms with the Occurrence and Development of Non-small Cell Lung Cancer in a Chinese Han Population in Yunnan Province

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目录

[1]	洪超, 向旭东, 李盈甫, 曹杨, 陈雪雅, 李帅, 邢安灏, 林牧, 马千里. ERK1/2信号通路基因3'UTR多态性与非小细胞肺癌的相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240302
[2]	牛志鑫, 汤丽华, 史磊, 洪超, 姚宇峰, 严志凌. MAPK1与NRAS基因多态性与云南汉族人群宫颈上皮内瘤变的相关性, 昆明医科大学学报.
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[4]	李春桃, 张雪梅, 苏琰迪, 张剑青. 过表达及敲减LncRNA RP11-521C20.3的非小细胞肺癌A549稳转细胞株的构建, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20231016
[5]	陆小华, 袁洪新. BTLA、CTLA-4基因多态性与肝癌TACE联合靶向治疗疗效及预后相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230927
[6]	董妍, 李雯雯, 崔文龙, 刘杰, 毕卫红. 云南省两县农村老年人慢性病与体力劳动强度相关性分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230303
[7]	梁燕, 王磊, 雷鸣, 陈本超, 孙萍, 李帅, 刘莉, 王倩蓉, 廖曼霖, 马千里. KRAS基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌的相关性分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230210
[8]	马燕粉, 胡健, 蔡德佩, 乔永峰, 王晓琴. 3137例体检人群血清GGT水平和血脂指标的相关性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20221001
[9]	张天红, 杨红菊. 外泌体miRNA在肝细胞癌中的研究进展, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220221
[10]	王应霞, 何琴, 王国芳, 张旋. 非小细胞肺癌中microRNA-21和EGFR的表达及意义, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20210818
[11]	崔朴梅, 陈太方, 陈超, 梁永梅, 徐悦. 云南某医院2016年至2019年抗菌药物使用与常见细菌耐药性的相关性分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20211127
[12]	陈本超, 李恒, 刘超, 王书廷, 李高峰. G蛋白偶联受体激酶5与非小细胞肺癌的临床相关性, 昆明医科大学学报.
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[15]	唐诗聪, 潘泓, 黄耀元, 周鑫, 王守峰, 左传田, 茅乃权. 人非小细胞肺癌裸鼠移植瘤模型的建立, 昆明医科大学学报.
[16]	周喆焱. E-cadherin对非小细胞肺癌的转移和靶向治疗的影响, 昆明医科大学学报.
[17]	张红. 外周血红细胞和血红蛋白因素与高原地区高尿酸血症患者相关性分析, 昆明医科大学学报.
[18]	赵金友. 云南省城市空巢老人孤独状况与生命质量相关性分析, 昆明医科大学学报.
[19]	杨芳. 两种不同形式的TNF相关凋亡诱导配体对非小细胞肺癌作用的研究, 昆明医科大学学报.
[20]	张兰凤. 易瑞沙治疗晚期非小细胞肺癌的临床观察, 昆明医科大学学报.

留言板

云南汉族人群mircoRNA-149、mircoRNA-219、mircoRNA-let-7基因多态性与非小细胞肺癌发生和发展的相关性

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20211037

作者简介: 杨佳（1985～），女，云南大理人，理学学士，主管技师，主要从事免疫遗传学研究

通讯作者: 刘舒媛，E-mail: liushuyuan@imbcams.com.cn

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出版历程

Association of the miR-149,miR-219 and miR-let-7 Polymorphisms with the Occurrence and Development of Non-small Cell Lung Cancer in a Chinese Han Population in Yunnan Province

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出版历程

目录

作者简介:
杨佳（1985～），女，云南大理人，理学学士，主管技师，主要从事免疫遗传学研究

通讯作者:
刘舒媛，E-mail: liushuyuan@imbcams.com.cn