云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性

魏巍; 张寿勋; 徐冲冲; 姜焰凌; 李屹; 杨朔; 韩建利; 黎宽; 赵斐; 杨晓佩; 张柠; 卢晓筱; 钟树荣

doi:10.12259/j.issn.2095-610X.S20220510

云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220510

魏巍¹,
张寿勋¹,
徐冲冲¹,
姜焰凌²,
李屹³,
杨朔¹,
韩建利³,
黎宽¹,
赵斐^{1, 4},
杨晓佩^{1, 5},
张柠¹,
卢晓筱^{1, 6, ,},
钟树荣^{1, 7, ,}

1.
昆明医科大学法医学院，云南昆明　650500
2.
昆明医科大学公共卫生学院，云南昆明　650500
3.
大理白族自治州公安司法鉴定中心，云南大理　671000
4.
江西神州司法鉴定中心，江西南昌　330000
5.
楚雄医药高等专科学校，云南楚雄　675005
6.
北京通达首诚司法鉴定所，北京　100089
7.
昆明医科大学司法鉴定中心，云南昆明　650500

基金项目: 国家自然科学基金资助项目（81660232， 81000577），云南省科技厅生物医药领域重大专项基金资助项目（2019ZF003），昆明医科大学百名中青年学术技术骨干基金资助项目（60117190413）。

详细信息

作者简介:
魏巍（1995～），男，四川巴中人，在读硕士研究生，主要从事法医物证研究工作。张寿勋与魏巍对本文有同等贡献

通讯作者:
卢晓筱，E-mail：470678544@qq.com

钟树荣，E-mail：zhongshurong@hotmail.com

中图分类号: R394
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出版历程
- 收稿日期: 2022-01-11
- 网络出版日期: 2022-05-19
- 刊出日期: 2022-05-27

Population Genetic Analysis of 18 Autosomal STR Loci in Minjia Branch of Bai Nationality in Yunnan Province, Southwest China

Wei WEI¹,
Shouxun ZHANG¹,
Chongchong XU¹,
Yanling JIANG²,
Yi LI³,
Shuo YANG¹,
Jianli HAN³,
Kuan LI¹,
Fei ZHAO^{1, 4},
Xiaopei YANG^{1, 5},
Neng ZHANG¹,
Xiaoxiao LU^{1, 6
, ,},
Shurong ZHONG^{1, 7
, ,}

1.
School of Forensic Medicine
2.
School of Public Health，Kunming Medical University，Kunming Yunnan 650500
3.
Forensic Center of Public Security of Dali Prefecture，Dali Yunnan 671000
4.
Jiangxi Shenzhou Judicial Identification Center，Nanchang Jiangxi 330000
5.
Chuxiong Medical College，ChuxiongYunnan 675005
6.
Beijing Tongda Shoucheng Institute of Forensic Science，Beijing 100089
7.
Judicial Identification Center of Kunming Medical University，Kunming Yunnan 650500，China

摘要

摘要: 目的调查云南白族民家支系2 323个健康无亲缘关系个体18个STR基因座的遗传多态性，计算群体遗传学参数，建立云南白族民家支系群体的遗传学基础数据，为司法鉴定工作中的亲子鉴定和个体识别提供可靠的科学依据。方法收集2323份云南白族民家支系人群无关个体样本，采用DNATyper^TM19试剂盒，进行直接PCR复合扩增，用AB 3130XL自动遗传分析仪进行毛细管电泳分离，用GeneMapper ID-X 1.5软件对分离的STR进行分型。使用Modified-Powerstats软件统计等位基因频率，进行Hardy-Weinberg平衡（HWE）检验，计算匹配概率等法医学参数。使用Arlequin软件计算Fst和P值。使用Phylip软件计算Nei’s遗传距离。使用SPSS软件进行多维尺度（MDS）分析。应用Mega软件构建相邻连接（NJ）系统发育树。结果 18个STR基因座中共观察到230个等位基因和1073种基因型。除D13S317基因座不符合Hardy-Weinberg平衡（P = 0.0008）外，其余基因座等位基因频率和基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05/18 = 0.0028）。18个STR基因座的累积个人识别能力（CDP）达0.999999999，累积非父排除概率（CPE）达0.99999994055。Fst值、Nei's遗传距离以及NJ系统发育树的结果均提示，白族民家支系与云南布朗族和云南佤族相距较远，而与大理白族和怒江白族相距较近。结论上述18个STR基因座在云南白族民家支系群体中具有高度多态性，可用于司法鉴定和群体遗传结构研究。
- 群体遗传 /
- 常染色体短串联重复 /
- 遗传多态性 /
- 白族民家支系
Abstract: Objective To investigate the genetic polymorphism of 18 autosomal short tandem repeats （STR）loci in 2323 healthy unrelated individuals of Minjia branch of Bai nationality in Yunnan, calculate the population genetic parameters, and establish the genetic data of Minjia branch of Bai nationality in Yunnan, so as to provide the scientific basis for the parental identification and individual identification of forensic material evidence. Methods A total of 2323 unrelated individuals from Minjia branch of Bai nationality population were collected. DNA Typer^TM 19 kit was used for direct PCR compound amplification. AB 3130XL automatic genetic analyzer was used to separate the PCR compound amplification products by capillary electrophoresis. STR typing was performed with GeneMapper ID-x 1.5 software. Forensic parameters, such as allele frequency and matching probability, were calculated by Modified Powerstats software, and the hardy-Weinberg equilibrium （HWE） test was performed. The Fst and P values were calculated using Arlequin software. Nei’s genetic distance was calculated using Phylip software. Multi-dimensional scale （MDS） analysis was performed using SPSS software. The Neighbor-Joining （NJ） phylogenetic tree was constructed by Mega software. Results A total of 230 alleles and 1073 genotypes were observed at 18 STR loci. Except that D13S317 loci was not in accord with Hardy-Weinberg equilibrium （P = 0.0008）, the allele frequencies and genotype frequencies of other loci were consistent with Hardy-Weinberg equilibrium （P > 0.05/20 = 0.0025）. The cumulative discrimination power （CDP） and cumulative probability of exclusion （CPE） of 18 STR loci were 0.999999999 and 0.99999994055, respectively. The results of Fst, Nei’s genetic distance and NJ phylogenetic tree indicated that the Minjia branch of Bai nationality was close to the Bai nationality in Nujiang and the Bai nationality in Dali, but far away from the Bulang nationality in Yunnan and Va nationality in Yunnan. Conclusion The 18 STR loci mentioned above show the high genetic polymorphism in the Minjia branch of Bai nationality and they can be used for the forensic identification and population genetics research.
- Population genetic /
- Short tandem repeat /
- Genetic polymorphism /
- Minjia branch of Bai nationality

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图 1 白族民家支系与21个已发表人群的系统发育树

Figure 1. The phylogenetic tree showing the relationship of the Minjia branch of Bai nationality and 21 published populations

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图 2 白族民家支系与21个已发表人群的MDS分析（基于Nei’s遗传距离矩阵）

Figure 2. Multidimensional scaling （MDS） plot based on Nei’s standard genetic distances matrix among Minjia branch of Bai nationality and 21 published populations

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表 1 白族民家支系18个STR基因座的等位基因频率及法医学参数（n = 2323）（1）

Table 1. Allele frequencies and forensic parameters of 18 STRs in Minjia branch of Bai ethnic minority （n = 2323）（1）

Allele	D3S1358	D6S1043	D13S317	Penta E	D16S539	D18S51	D2S1338	CSF1PO	TH01	vWA	D21S11	D7S820	D5S818	TPOX	D8S1179	D12S391	D19S433	FGA
5				0.0458					0.0009
6				0.0002					0.0846
7			0.0022	0.0011				0.0019	0.2833			0.0013	0.0217	0.0009
7.3
8		0.0011	0.2749	0.0110	0.0075			0.0009	0.0628			0.1291	0.0006	0.5093
8.1
9		0.0028	0.1369	0.0065	0.2400	0.0002		0.0426	0.4957			0.0719	0.0773	0.1244	0.0004		0.0037
9.1												0.0006
9.3									0.0454
10		0.0353	0.1440	0.0347	0.1104	0.0009		0.2374	0.0271			0.1614	0.1920	0.0239	0.0945		0.0006
10.1												0.0015
11		0.1197	0.2322	0.1894	0.3037	0.0026		0.2443	0.0002			0.3259	0.3250	0.3117	0.0771		0.0028
12	0.0004	0.1438	0.1627	0.1257	0.2163	0.0224		0.3898				0.2658	0.2331	0.0295	0.1156		0.0357
12.2																	0.0140
13	0.0013	0.1382	0.0366	0.0560	0.1089	0.2086		0.0766		0.0002		0.0362	0.1332	0.0004	0.2548		0.2785
13.2																	0.0517
14	0.0418	0.1203	0.0105	0.0859	0.0123	0.2023		0.0058		0.2286		0.0058	0.0157		0.1901		0.2499
14.2																	0.0977
15	0.3549	0.0129		0.0803	0.0009	0.1950		0.0006		0.0276		0.0004	0.0011		0.1722	0.0118	0.0687
15.2																	0.1429
16	0.3487	0.0009		0.0986		0.1319	0.0149			0.1746			0.0002		0.0755	0.0065	0.0133
16.2																	0.0355
17	0.1754	0.0502		0.0605		0.0809	0.0493			0.2566					0.0161	0.1009	0.0017	0.0006
17.2																	0.0024
17.3																0.0004
18	0.0710	0.1651		0.0678		0.0402	0.1009			0.2058					0.0037	0.2660	0.0006	0.0327
18.2																0.0002	0.0002
18.3																0.0009
19	0.0058	0.1455		0.0489		0.0390	0.1754			0.0876						0.2004		0.0439
20	0.0006	0.0478		0.0433		0.0224	0.1274			0.0181						0.1573		0.0654
20.2		0.0002																0.0006
20.3		0.0022
21		0.0062		0.0245		0.0183	0.0512			0.0011						0.0994		0.1009
21.1																		0.0002
21.2		0.0004																0.0077
21.3		0.0071
注：Pm: 随机匹配概率; DP: 个体识别能力; PIC: 多态性信息含量; PE: 非父排除概率;TPI: 典型亲权指数; Ho: 观测值杂合度；p-value: Hardy-Weinberg平衡（HWE）检验P值.

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表 1 白族民家支系18个STR基因座的等位基因频率及法医学参数（n = 2323）（2）

Table 1. Allele frequencies and forensic parameters of 18 STRs in Minjia branch of Bai ethnic minority （n = 2323）（2）

Allele	D3S1358	D6S1043	D13S317	Penta E	D16S539	D18S51	D2S1338	CSF1PO	TH01	vWA	D21S11	D7S820	D5S818	TPOX	D8S1179	D12S391	D19S433	FGA
22		0.0004		0.0084		0.0187	0.0420									0.0880		0.1707
22.2																		0.0065
23				0.0043		0.0084	0.2260									0.0536		0.2273
23.2																		0.0123
24				0.0045		0.0054	0.1446									0.0075		0.1672
24.2																		0.0170
25				0.0019		0.0022	0.0570									0.0060		0.0895
25.2																		0.0024
26				0.0009		0.0006	0.0095									0.0009		0.0426
26.2																		0.0013
27							0.0015				0.0024							0.0065
28							0.0002				0.0508							0.0045
28.2											0.0166
29											0.2484
29.2											0.0028
30											0.2652
30.1											0.0002
30.2											0.0230
30.3											0.0006
31											0.1007
31.2											0.0687
32											0.0284
32.2											0.1337
33											0.0024
33.2											0.0463
34.2											0.0093
35.2											0.0006
Pm	0.1292	0.0283	0.0654	0.0166	0.0837	0.0408	0.0348	0.1210	0.1654	0.0691	0.0495	0.0854	0.0823	0.2023	0.0468	0.0476	0.0542	0.0334
DP	0.8708	0.9717	0.9346	0.9834	0.9163	0.9592	0.9652	0.8790	0.8346	0.9309	0.9505	0.9146	0.9177	0.7977	0.9532	0.9524	0.9458	0.9666
PIC	0.6652	0.8639	0.7744	0.8977	0.7446	0.8311	0.8453	0.6781	0.6115	0.7703	0.8087	0.7400	0.7456	0.5641	0.8146	0.8131	0.7976	0.8491
PE	0.4315	0.7312	0.5548	0.7939	0.5403	0.6708	0.7029	0.4478	0.3745	0.5844	0.6384	0.5679	0.5610	0.3182	0.6401	0.6393	0.6148	0.7191
TPI	1.6785	3.7958	2.2294	4.9637	2.1509	3.0809	3.4263	1.7388	1.4872	2.4048	2.7921	2.3046	2.2641	1.3229	2.8056	2.7988	2.6101	3.6297
Ho	0.7021	0.8683	0.7757	0.8993	0.7675	0.8377	0.8541	0.7124	0.6638	0.7920	0.8209	0.7830	0.7792	0.6220	0.8218	0.8214	0.8084	0.8622
HWE（p-value）	0.1687	0.2066	0.0008	0.3332	0.1724	0.1348	0.3628	0.1954	0.7213	0.3084	0.3011	0.3009	0.9749	0.6396	0.0800	0.1155	0.1521	0.8597
注：Pm：随机匹配概率；DP：个体识别能力；PIC：多态性信息含量；PE：非父排除概率；TPI：典型亲权指数；Ho：观测值杂合度；p-value：Hardy-Weinberg平衡（HWE）检验P值。

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表 2 白族民家支系与21个已发表人群的Fst和P值（1）

Table 2. Pairwise Fst and P values between Minjia branch of Baiethnic minority and 21 published populations （1）

民族	STR基因座
	CSF1PO		D2S1338		D3S1358		D5S818		D7S820
	Fst	P	Fst	P	Fst	P	Fst	P	Fst	P
喀什地区维吾尔族	0.00323	< 0.00001^#	0.00541	< 0.00001^#	0.00311	< 0.00001^#	0.00659	< 0.00001^#	0.01279	< 0.00001^#
云南佤族	0.00248	0.00195^#	0.00708	< 0.00001^#	0.01609	< 0.00001^#	0.01171	< 0.00001^#	0.00165	0.00684^*
广西侗族	0.00068	0.04102^*	0.00309	< 0.00001^#	0.00422	< 0.00001^#	0.00177	< 0.00001^#	0.00702	< 0.00001^#
海南黎族	0.00050	0.19922	0.00632	< 0.00001^#	0.00509	< 0.00001^#	0.00268	0.00488^*	0.00223	0.01660^*
昌都藏族	0.00117	0.00879^*	0.00029	0.09473	0.28350	< 0.00001^#	0.00140	0.00488^*	0.00051	0.06543
四川汉族	−0.00129	0.83691	−0.00031	0.55566	−0.00077	0.60059	−0.00130	0.89355	−0.00030	0.46680
云南布朗族	0.00449	0.04102^*	0.00557	0.00391^*	0.00945	0.00293^#	0.00376	0.04688^*	−0.00037	0.48047
云南哈尼族	0.00217	0.02539^*	0.00441	< 0.00001^#	0.00162	0.04883^*	0.00318	0.00195^#	0.00168	0.02148^*
云南地区越南人群	0.01493	< 0.00001^#	0.00689	< 0.00001^#	0.02162	< 0.00001^#	0.00130	0.07617	0.02601	< 0.00001^#
贵州仡佬族	−0.00062	0.63477	−0.00046	0.66992	0.00161	0.09082	−0.00056	0.66504	0.00238	0.04004^*
云南汉族	−0.00025	0.72852	0.00050	0.04395^*	0.00083	0.03711^*	0.00056	0.07910	0.00369	< 0.00001^#
彝族	0.00007	0.33105	0.00031	0.26758	0.00074	0.19531	0.00050	0.25000	−0.00095	0.89062
纳西族	−0.00095	0.90430	−0.00023	0.57617	−0.00006	0.36816	0.00000	0.40332	0.00037	0.24023
日本人群	0.00214	0.01562^*	0.01237	< 0.00001^#	0.00326	0.00977^*	0.00084	0.10352	0.00425	< 0.00001^#
印度人群	0.00364	0.02734^*	0.00318	0.00488^*	0.00547	0.00488^*	0.00498	0.00391^*	0.01890	< 0.00001^#
宁夏回族	−0.00041	0.64453	0.00052	0.12402	0.00117	0.06641	0.00042	0.19043	0.00183	0.01562^*
伊犁维吾尔族	0.00387	0.03223^*	0.10822	< 0.00001^#	0.00544	0.01367^*	0.00796	0.00195^#	0.00851	< 0.00001^#
长沙汉族	0.00010	0.27051	0.00039	0.07031	0.00288	< 0.00001^#	0.00032	0.13379	0.00124	0.01074^*
拉萨藏族	−0.00197	0.85840	0.00085	0.23828	0.00083	0.25391	0.00214	0.13379	0.00019	0.36230
怒江白族	0.00440	0.09473	−0.00277	0.93262	−0.00212	0.71289	0.00262	0.17969	−0.00293	0.86816
大理白族	−0.00020	0.52148	−0.00050	0.97852	0.00034	0.20312	0.00006	0.35547	−0.00043	0.85742
即使在Bonforroni校正后，本研究人群与比较人群之间的Fst值也存在显著差异（^#P < 0.05/15 = 0.0033）；^*P < 0.05。

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表 2 白族民家支系与21个已发表人群的Fst和P值（2）

Table 2. Pairwise Fst and P values between Minjia branch of Bai ethnic minority and 21 published populations （2）

民族	STR基因座
	D8S1179		D13S317		D16S539		D18S51		D19S433
	Fst	P	Fst	P	Fst	P	Fst	P	Fst	P
喀什地区维吾尔族	0.00074	0.00781^*	0.01187	< 0.00001^#	0.00128	0.00195^#	0.00397	< 0.00001^#	0.00308	< 0.00001^#
云南佤族	0.00380	< 0.00001^#	0.00854	< 0.00001^#	0.00645	< 0.00001^#	0.00626	< 0.00001^#	0.00365	< 0.00001^#
广西侗族	0.01678	< 0.00001^#	0.00722	< 0.00001^#	0.00182	< 0.00001^#	0.00464	< 0.00001^#	0.00050	0.04395^*
海南黎族	0.01014	< 0.00001^#	0.00329	0.00293^#	0.00163	0.03223^*	0.00464	< 0.00001^#	0.00048	0.17383
昌都藏族	0.00132	0.00098^#	0.13054	< 0.00001^#	0.00113	0.00879^*	0.00509	< 0.00001^#	0.00144	< 0.00001^#
四川汉族	−0.00053	0.58496	−0.00084	0.73633	0.00581	0.00293^#	0.00041	0.24707	−0.00102	0.83691
云南布朗族	0.00219	0.09961	0.00074	0.27734	0.00351	0.07031	−0.00175	0.93945	0.00425	0.01953^*
云南哈尼族	0.00493	< 0.00001^#	0.00244	0.00391^*	0.00457	0.00098^#	0.00544	< 0.00001^#	0.00236	0.00293^#
云南地区越南人群	0.03193	< 0.00001^#	0.03207	< 0.00001^#	0.01673	< 0.00001^#	0.00364	0.00098^#	0.01629	< 0.00001^#
贵州仡佬族	0.00044	0.24512	0.00053	0.21973	−0.00102	0.88086	−0.00025	0.53125	0.00009	0.37012
云南汉族	0.00442	< 0.00001^#	0.00097	0.01172^*	0.00094	0.01172^*	0.00046	0.06152	0.00033	0.12012
彝族	0.00046	0.23145	0.00184	0.04883^*	−0.00035	0.55273	0.00115	0.09668	0.00155	0.05566
纳西族	0.00516	< 0.00001^#	−0.00113	0.99707	0.00114	0.10840	−0.00030	0.61719	−0.00018	0.51855
日本人群	0.00392	< 0.00001^#	0.00143	0.03516^*	0.02029	< 0.00001^#	0.00092	0.05664	0.00175	0.01855^*
印度人群	0.07056	< 0.00001^#	0.01050	< 0.00001^#	0.00631	< 0.00001^#	0.14905	< 0.00001^#	0.00632	< 0.00001^#
宁夏回族	0.00001	0.39844	0.00136	0.04785^*	0.00021	0.27539	0.00090	0.06348	−0.00029	0.65137
伊犁维吾尔族	0.00284	0.02734^*	0.01284	< 0.00001^#	0.00132	0.12793	0.00412	0.00391^*	0.00345	0.02734^*
长沙汉族	0.00194	< 0.00001^#	0.00084	0.03027^*	0.00143	0.00391^*	0.00050	0.04688^*	−0.00001	0.39648
拉萨藏族	0.00047	0.28320	0.00874	0.00488^*	0.00253	0.10156	0.00456	0.01953^*	0.00389	0.03223^*
怒江白族	−0.00176	0.73047	0.00081	0.29980	0.00307	0.14160	0.00013	0.39648	0.00289	0.13477
大理白族	0.00092	0.04004^*	−0.00044	0.87500	0.00015	0.29590	−0.00036	0.86328	0.00012	0.29785
注：黑色加粗的值表明，即使在Bonforroni校正后，本研究人群与比较人群之间的Fst值也存在显著差异（^#P < 0.05/15 = 0.0033）；^*P < 0.05。

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表 2 白族民家支系与21个已发表人群的Fst和P值（3）

Table 2. Pairwise Fst and P values between Minjia branch of Bai ethnic minority and 21 published populations （3）

民族	STR基因座
	D21S11		FGA		TH01		TPOX		vWA
	Fst	p	Fst	P	Fst	P	Fst	p	Fst	P
喀什地区维吾尔族	0.00410	< 0.00001^#	0.00212	< 0.00001^#	0.04589	< 0.00001^#	0.00207	0.00098^#	0.00704	< 0.00001^#
云南佤族	0.00520	< 0.00001^#	0.00407	< 0.00001^#	0.00953	< 0.00001^#	0.02182	< 0.00001^#	0.19039	< 0.00001^#
广西侗族	0.00069	0.00977^*	0.00471	< 0.00001^#	0.00171	< 0.00001^#	0.00096	0.03809^*	0.01037	< 0.00001^#
海南黎族	0.00127	0.04297^*	0.00395	< 0.00001^#	0.00453	0.00098^#	0.00347	0.01172^*	0.00447	< 0.00001^#
昌都藏族	0.00052	0.05762	0.00213	< 0.00001^#	0.00136	0.00781^*	0.01058	< 0.00001^#	0.00314	< 0.00001^#
四川汉族	0.00036	0.29492	0.00112	0.13867	−0.00142	0.92090	−0.00119	0.75684	−0.00105	0.81738
云南布朗族	0.00462	0.01074^*	0.00144	0.13281	0.01066	0.00488^*	0.02201	0.00098^#	0.00084	0.23535
云南哈尼族	0.00526	< 0.00001^#	0.00487	< 0.00001^#	0.00075	0.14160	0.01292	< 0.00001^#	0.00207	0.01465^*
云南地区越南人群	0.00664	0.00098^#	0.01939	< 0.00001^#	0.00954	< 0.00001^#	0.04698	< 0.00001^#	0.01099	< 0.00001^#
贵州仡佬族	0.00035	0.26562	−0.00033	0.58984	−0.00027	0.44922	−0.00092	0.71582	0.00086	0.17773
云南汉族	−0.00011	0.58691	0.00062	0.02441^*	0.00015	0.22559	0.00046	0.12402	0.00161	0.00195^#
彝族	−0.00034	0.60840	−0.00115	0.99414	0.00104	0.13965	−0.00059	0.57422	0.00060	0.21973
纳西族	0.00150	0.04590^*	0.00048	0.19922	0.00039	0.25195	0.00037	0.24023	−0.00049	0.70020
日本人群	0.00346	< 0.00001^#	0.00073	0.08887	0.02701	< 0.00001^#	0.00314	0.01758^*	−0.00049	0.75488
印度人群	0.01773	< 0.00001^#	0.00474	0.00098^#	0.07503	< 0.00001^#	0.03121	< 0.00001^#	0.01042	< 0.00001^#
宁夏回族	0.00024	0.26074	0.00028	0.22363	0.00024	0.22852	0.00034	0.20703	0.00080	0.09277
伊犁维吾尔族	0.06856	< 0.00001^#	0.00305	0.01660^*	0.05871	< 0.00001^#	0.00044	0.27148	0.00944	< 0.00001^#
长沙汉族	0.00015	0.22363	0.00025	0.15430	0.00040	0.12793	−0.00013	0.47656	0.00077	0.02734^*
拉萨藏族	0.00042	0.32520	0.00294	0.04883^*	−0.00087	0.54883	0.00713	0.03125^*	−0.00062	0.51953
怒江白族	−0.00227	0.83887	0.00278	0.11523	−0.00052	0.42871	0.00201	0.20020	−0.00349	0.96777
大理白族	0.00150	0.00977^*	−0.00018	0.63574	0.00062	0.12695	−0.00016	0.47559	−0.00060	0.99121
即使在Bonforroni校正后，本研究人群与比较人群之间的Fst值也存在显著差异（^#P < 0.05/15 = 0.0033）；^*P < 0.05。

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表 3 白族民家支系与21个已发表人群的Nei's遗传距离

Table 3. Nei's standard genetic distances between Minjia branch of Bai nationality and 21 published populations.

	[1]	[2]	[3]	[4]	[5]	[6]	[7]	[8]	[9]	[10]	[11]	[12]	[13]	[14]	[15]	[16]	[17]	[18]	[19]	[20]	[21]	[22]
白族民家支系[1]	0.000000
喀什地区维吾尔族[2]	0.107646	0.000000
云南佤族[3]	0.114762	0.177184	0.000000
广西侗族[4]	0.145404	0.217277	0.096202	0.000000
海南黎族[5]	0.124407	0.227674	0.038474	0.096235	0.000000
昌都藏族[6]	0.118570	0.177630	0.073168	0.024859	0.085629	0.000000
四川汉族[7]	0.116581	0.180529	0.070624	0.035347	0.087920	0.005196	0.000000
云南布朗族[8]	0.415857	0.579774	0.398897	0.387094	0.397545	0.348782	0.355437	0.000000
云南哈尼族[9]	0.103179	0.203859	0.048691	0.059480	0.043724	0.034243	0.028206	0.365319	0.000000
云南地区越南人群[10]	0.098524	0.172589	0.059345	0.032926	0.076531	0.007025	0.008501	0.329172	0.024481	0.000000
贵州仡佬族[11]	0.115547	0.149589	0.067855	0.049599	0.093779	0.016923	0.018700	0.360752	0.049616	0.016962	0.000000
云南汉族[12]	0.097612	0.181988	0.058948	0.043558	0.072595	0.014636	0.014362	0.321431	0.025772	0.003780	0.023229	0.000000
彝族[13]	0.094028	0.189993	0.061012	0.054904	0.076758	0.022721	0.021975	0.327090	0.022979	0.008102	0.032636	0.008336	0.000000
纳西族[14]	0.094438	0.173688	0.058978	0.058992	0.078381	0.023124	0.018060	0.335448	0.024818	0.008774	0.023248	0.010194	0.009089	0.000000
日本人群[15]	0.099462	0.185518	0.066168	0.036783	0.080251	0.008683	0.010243	0.325122	0.026606	0.003187	0.023679	0.006106	0.008231	0.011813	0.000000
印度人群[16]	0.105637	0.186014	0.077436	0.059716	0.099815	0.024326	0.022901	0.334689	0.045724	0.014013	0.029487	0.014439	0.018083	0.019465	0.018190	0.000000
宁夏回族[17]	0.092766	0.179012	0.060018	0.053387	0.079086	0.017582	0.015580	0.320730	0.024201	0.004171	0.024065	0.003949	0.003815	0.006234	0.005949	0.011384	0.000000
伊犁维地区吾尔族[18]	0.011876	0.095765	0.100860	0.130743	0.108918	0.099432	0.099592	0.412676	0.091099	0.083543	0.096303	0.084121	0.084766	0.087187	0.084149	0.096855	0.081386	0.000000
长沙汉族[19]	0.050266	0.124632	0.097791	0.191280	0.091328	0.158492	0.153777	0.488916	0.125838	0.140880	0.136507	0.137303	0.142069	0.132549	0.147205	0.154349	0.138767	0.037496	0.000000
拉萨藏族[20]	0.019893	0.083069	0.118218	0.114822	0.127158	0.086276	0.087764	0.438257	0.095018	0.080479	0.087737	0.085672	0.089791	0.088243	0.082420	0.095327	0.084116	0.007435	0.053767	0.000000
怒江白族[21]	0.026784	0.091790	0.135895	0.142791	0.157151	0.111704	0.109450	0.448717	0.113373	0.097324	0.109013	0.103929	0.098482	0.099007	0.096941	0.117884	0.096831	0.014561	0.071961	0.014081	0.000000
大理白族[22]	0.015095	0.085721	0.112248	0.130195	0.122038	0.094348	0.096091	0.423142	0.096458	0.081886	0.090705	0.084250	0.082848	0.084821	0.083601	0.09195	0.07896	0.00521	0.04733	0.00502	0.01303	0.00000

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参考文献(34)

[1]	张旭. 大理白族史探索[M]. 昆明: 云南人民出版社, 1990: 1-2.
[2]	Bra W,Brinkmann B,Budowle B,et al. DNA recommendations. Further report of the DNA Commission of the ISFH regarding the use of short tandem repeat systems. International Society for Forensic Haemogenetics[J]. Int J Legal Med,1997,110(4):175-176. doi: 10.1007/s004140050061
[3]	Lincoln P J. DNA recommendations-further report of the DNA Commission of the ISFH regarding the use of short tandem repeat systems[J]. Forensic Sci Int,1997,87(3):181-184.
[4]	赵方,伍新尧,蔡贵庆,等. Modified-Powerstates软件在法医生物统计中应用[J]. 中国法医学杂志,2003,18(5):297-298. doi: 10.3969/j.issn.1001-5728.2003.05.015
[5]	Excoffier L,Lischer H E. Arlequin suite ver 3.5:A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows[J]. Mol Ecol Resour,2010,10(3):564-567. doi: 10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x
[6]	Kumar S,Stecher G,Tamura K. MEGA7:Molecular evolutionary genetics analysis Version 7.0 for bigger datasets[J]. Mol Biol Evol,2016,33(7):1870-1874. doi: 10.1093/molbev/msw054
[7]	Fan H,Wang X,Ren Z,et al. Population data of 19 autosomal STR loci in the Li population from Hainan Province in southernmost China[J]. Int J Legal Med,2019,133(2):429-431. doi: 10.1007/s00414-018-1828-2
[8]	高波,邱平明. 新疆伊犁州维吾尔族20个STR基因座的遗传多态性[J]. 分子诊断与治疗杂志,2015,7(6):407-411. doi: 10.3969/j.issn.1674-6929.2015.06.009
[9]	Guo F. Allele frequencies of 17 autosomal STR loci in the Va ethnic minority from Yunnan Province,Southwest China[J]. Int J Legal Med,2017,131(5):1251-1252. doi: 10.1007/s00414-017-1620-8
[10]	Guo F. Genetic variation of 17 autosomal STR loci in the Dong ethnic minority from Guangxi Zhuang Autonomous Region,South China[J]. Int J Legal Med,2017,131(6):1537-1538. doi: 10.1007/s00414-017-1576-8
[11]	Hashiyada M,Itakura Y,Nagashima T,et al. Polymorphism of 17 STRs by multiplex analysis in Japanese population[J]. Forensic Sci Int,2003,133(3):250-253. doi: 10.1016/S0379-0738(03)00075-6
[12]	He G,Su Y,Zou X,et al. Allele frequencies of 15 autosomal STRs in Chinese Nakhi and Yi populations[J]. Int J Legal Med,2019,133(1):105-108. doi: 10.1007/s00414-018-1931-4
[13]	He G,Wang M,Liu J,et al. Forensic features and phylogenetic analyses of Sichuan Han population via 23 autosomal STR loci included in the Huaxia Platinum System[J]. Int J Legal Med,2018,132(4):1079-1082. doi: 10.1007/s00414-017-1679-2
[14]	Huang Y,Yao J,Li J,et al. Population genetic data for 17 autosomal STR markers in the Hani population from China[J]. Int J Legal Med,2015,129(5):995-996. doi: 10.1007/s00414-015-1176-4
[15]	Kang L L,Zhao J,Liu K,et al. Allele frequencies of 15 STR loci of Tibetan lived in Xizang Lassa[J]. Forensic Sci Int,2007,168(2-3):236-240. doi: 10.1016/j.forsciint.2006.02.041 Kang L L,Zhao J,Liu K,et al. Allele frequencies of 15 STR loci of Tibetan lived in Xizang Lassa[J]. Forensic Sci Int,2007,168(2-3):236-240. doi: 10.1016/j.forsciint.2006.02.041
[16]	Li L,Zhang Y,Wang W,et al. Allele frequencies of 20 autosomal STR loci for 207 unrelated individuals of the Blang people in China[J]. Int J Legal Med,2020,134(3):987-988. doi: 10.1007/s00414-019-02192-0
[17]	Li Y,Hong Y,Li X,et al. Allele frequency of 19 autosomal STR loci in the Bai population from the southwestern region of Mainland of China[J]. Electrophoresis,2015,36(19):2498-2503. doi: 10.1002/elps.201500129
[18]	Li Z,Zhang J,Zhang H,et al. Genetic polymorphisms in 18 autosomal STR loci in the Tibetan population living in Xizang Chamdo,Southwest China[J]. Int J Legal Med,2018,132(3):733-734. doi: 10.1007/s00414-017-1740-1 Li Z,Zhang J,Zhang H,et al. Genetic polymorphisms in 18 autosomal STR loci in the Tibetan population living in Xizang Chamdo,Southwest China[J]. Int J Legal Med,2018,132(3):733-734. doi: 10.1007/s00414-017-1740-1
[19]	刘亚举,李瑾,岳俊涛,等. 贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体STR基因座的遗传多态性及遗传关系分析[J]. 解放军医学杂志,2019,44(8):682-689. doi: 10.11855/j.issn.0577-7402.2019.08.10
[20]	Singh M,Nandineni M R. Population genetic analyses and evaluation of 22 autosomal STRs in Indian populations[J]. Int J Legal Med,2017,131(4):971-973. doi: 10.1007/s00414-016-1525-y
[21]	Sun J S,Tian Q H,Zhao L,et al. Genetic polymorphisms of 18 autosomal STR loci in Changsha Han population[J]. Journal of forensic medicine,2018,34(5):526-531.
[22]	唐维,吴道来,陈立方,等. 云南白族15个常染色体STR基因座的遗传多态性[J]. 昆明医科大学学报,2016,37(5):128-131. doi: 10.3969/j.issn.1003-4706.2016.05.033
[23]	Zhang J,Li Z,Mo X,et al. Allele frequencies of 18 autosomal STR loci in the Uyghur population living in Kashgar Prefecture,Northwest China[J]. Int J Legal Med,2019,133(2):427-428. doi: 10.1007/s00414-018-1821-9
[24]	Zhang X,Hu L,Du L,et al. Genetic polymorphisms of 20 autosomal STR loci in the Vietnamese population from Yunnan Province,Southwest China[J]. Int J Legal Med,2017,131(3):661-662. doi: 10.1007/s00414-016-1496-z
[25]	Zhang X,Liu L,Xie R,et al. Population data and mutation rates of 20 autosomal STR loci in a Chinese Han population from Yunnan Province,Southwest China[J]. Int J Legal Med,2018,132(4):1083-1085. doi: 10.1007/s00414-017-1675-6
[26]	赵鹏,丁延云,张瑞智,等. 临夏回族人群15个STR多态性及与其他回族人群遗传关系初探[J]. 中国法医学杂志,2017,32(1):68-70.
[27]	赖江华,张保华,朱波峰,等. 云南白族STR遗传多态性研究[J]. 西安交通大学学报(医学版),2002,23(3):242-245. doi: 10.3969/j.issn.1671-8259.2002.03.010
[28]	侯一平. 法医物证学[M]. 第4版. 北京: 人民卫生出版社, 2016: 190.
[29]	中华人民共和国司法部. "亲权鉴定技术规范. "GB/T 37223-2018.2018-12-28.
[30]	包睿舜,吴兰. 《中国孟高棉语族语言与南亚语系》评介[J]. 世界民族,2004,27(6):77-78. doi: 10.3969/j.issn.1006-8287.2004.06.011
[31]	Cai X,Qin Z,Wen B,et al. Human migration through bottlenecks from Southeast Asia into East Asia during Last Glacial Maximum revealed by Y chromosomes[J]. PLoS One,2011,6(8):e24282. doi: 10.1371/journal.pone.0024282
[32]	戴庆厦,刘菊黄,傅爱兰. 关于我国藏缅语族系属分类问题[J]. 云南民族学院学报,1989,6(3):82-92.
[33]	Wang LX,Lu Y,Zhang C,et al. Reconstruction of Y-chromosome phylogeny reveals two neolithic expansions of Tibeto-Burman populations[J]. Mol Genet Genomics,2018,293(5):1293-1300. doi: 10.1007/s00438-018-1461-2
[34]	王嘉相. 勒墨人（白族支系）的迁徙与“指路歌”[A]. 政协怒江州委文史委. 怒江文史资料选辑[C]. 瑞丽: 德宏民族出版社, 1994: 63-65.

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云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220510

作者简介:
魏巍（1995～），男，四川巴中人，在读硕士研究生，主要从事法医物证研究工作。张寿勋与魏巍对本文有同等贡献

通讯作者:
卢晓筱，E-mail：470678544@qq.com

钟树荣，E-mail：zhongshurong@hotmail.com

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Population Genetic Analysis of 18 Autosomal STR Loci in Minjia Branch of Bai Nationality in Yunnan Province, Southwest China

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目录

[1]	石妍, 江坚, 陈冲, 张京晶, 贾莉, 高知枭, 李惠芬, 严江伟, 任贺. Microreader^TM 23HS Plex ID System中23个常染色体STR基因座在中国北方汉族人群中多态性调查, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240723
[2]	李光兴, 张韵梅, 刘程静, 王伟涛, 赵凯. 19个常染色体STR基因座在阿昌族和德昂族人群的多态性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230809
[3]	赵凯, 张韵梅, 王伟涛, 李光兴. 17个常染色体STR基因座在基诺族人群的遗传多态性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230627
[4]	徐冲冲, 王上, 魏巍, 张柠, 黎宽, 连心情, 王诗旭, 周雪梅, 卢晓筱, 钟树荣. 文山红河地区苗族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20221020
[5]	陈灿昆, 陈志彬, 杨靖宜, 杨钰, 范志祥, 张延洁, 张璐, 龙莉. CBS基因844ins68多态性在云南彝族中的分布, 昆明医科大学学报.
[6]	庞敬博, 李佳珏, 刘灿刚, 刘浩东, 吴波, 聂胜洁, 胡利平. 曲靖汉族人群19个STR基因座遗传多态性分析, 昆明医科大学学报.
[7]	张柠, 姜焰凌, 方宝雄, 计艾岑, 张秀峰, 张寿勋, 杨朔, 赵斐, 钟树荣. 云南苗族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[8]	杨朔, 姜焰凌, 方宝雄, 计艾岑, 张寿勋, 张秀峰, 张柠, 赵斐, 钟树荣. 云南彝族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[9]	杨朔, 卢晓筱, 张寿勋, 夏生, 张柠, 张秀峰, 李佳珏, 胡利平, 钟树荣. 云南壮族、傣族、哈尼族20个常染色体STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[10]	雷强, 肖月, 张微, 翟滇, 程宝文, 曾发明. 云南巍山回族27个Y-STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[11]	罗兰. 云南彝族男性AT1R A1166C、AGT M235T多态性及血生化指标与原发性高血压的相关性, 昆明医科大学学报.
[12]	胡利平. 云南汉族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[13]	唐维. 云南白族15个常染色体STR 基因座的遗传多态性, 昆明医科大学学报.
[14]	李盈甫. ARL 15基因rs4311394多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关联, 昆明医科大学学报.
[15]	马立宇. 云南白族人群13个快速突变（RM）Y-STR基因座多态性研究, 昆明医科大学学报.
[16]	李盈甫. 脂联素基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关联, 昆明医科大学学报.
[17]	余建华. 云南汉族人群15个常染色体STR基因座的遗传多态性与OL等位基因的研究, 昆明医科大学学报.
[18]	杨榆玲. 血管紧张素II 1型受体A1166C多态性在云南彝族人群中的分布, 昆明医科大学学报.
[19]	龙莉. 血管紧张素原基因M235T多态性在云南彝族人群中的分布, 昆明医科大学学报.
[20]	刘德华. 昆明地区汉族人群9个Y-STRs基因座遗传多态性及法医学应用研究, 昆明医科大学学报.

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云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220510

作者简介: 魏巍（1995～），男，四川巴中人，在读硕士研究生，主要从事法医物证研究工作。张寿勋与魏巍对本文有同等贡献

通讯作者: 卢晓筱，E-mail：470678544@qq.com 钟树荣，E-mail：zhongshurong@hotmail.com

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出版历程

Population Genetic Analysis of 18 Autosomal STR Loci in Minjia Branch of Bai Nationality in Yunnan Province, Southwest China

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出版历程

目录

作者简介:
魏巍（1995～），男，四川巴中人，在读硕士研究生，主要从事法医物证研究工作。张寿勋与魏巍对本文有同等贡献

通讯作者:
卢晓筱，E-mail：470678544@qq.com

钟树荣，E-mail：zhongshurong@hotmail.com