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肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响

杨红秀 朱中山

杨红秀, 朱中山. 肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响[J]. 昆明医科大学学报, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
引用本文: 杨红秀, 朱中山. 肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响[J]. 昆明医科大学学报, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
Hongxiu YANG, Zhongshan ZHU. Effect of HPRT1 Gene Expression on Overall Survival of Patients with Lung Adenocarcinoma[J]. Journal of Kunming Medical University, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
Citation: Hongxiu YANG, Zhongshan ZHU. Effect of HPRT1 Gene Expression on Overall Survival of Patients with Lung Adenocarcinoma[J]. Journal of Kunming Medical University, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803

肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
基金项目: 湖南省自然科学基金科卫联合基金资助项目(2020JJ8080)
详细信息
    作者简介:

    杨红秀(1975~),女,湖南怀化人,医学学士,副主任护师,主要从事肿瘤专业护理与科研工作

    通讯作者:

    朱中山,E-mail:84059616@qq.com

  • 中图分类号: R734.2

Effect of HPRT1 Gene Expression on Overall Survival of Patients with Lung Adenocarcinoma

  • 摘要:   目的  探索HPRT1基因在肺腺癌中的表达特征、总生存率、功能激活以及免疫浸润中的影响。  方法  通过对TCGA肺腺癌数据以及多个GEO数据库中的肺腺癌数据进行挖掘分析,对比并验证HPRT1表达量与预后总生存(overall surival,OS)的关系,通过clusterProfiler分析HPRT1基因高表达组中上调基因的功能富集情况。且通过TIMER以及CIBERSORT算法计算肺腺癌中不同免疫细胞的浸润水平并对比在HPRT1高低表达组间的浸润程度差异。  结果  HPRT1在肺腺癌组织中表达量显著上调,且在TCGA中证明HPRT1基因高表达的患者预后OS更差(P < 0.01)。经过2个GEO数据集的验证同样发现HPRT1基因高表达表现为预后OS更差(GSE13213,P < 0.01;GSE67639,P < 0.001)。差异分析显示高表达的患者中有683个基因的表达量显著上调且这些上调基因的功能主要富集与p53以及细胞周期等癌症相关的信号通路。TIMER以及CIBERSORT算法进行的免疫细胞浸润程度分析发现在高表达差预后人群中B细胞以及CD4T细胞含量均更低(P < 0.05)。  结论  HPRT1基因表达量越高肺腺癌患者的总生存越差,且高表达患者的p53信号通路上调,B细胞以及CD4T细胞浸润程度显著下降。
  • 图  1  HPRT1基因在肺腺癌样本中表达情况

    A:HPRT1基因在肺腺癌组织与癌旁组织的差异;B:HPRT1基因表达量在患者肺腺癌不同分期样本中的对比;C:肺腺癌组织中HPRT1基因抗体(HPA006360)IHC定量表达。

    Figure  1.  HPRT1 gene expression in lung adenocarcinoma samples

    图  2  HPRT1基因表达与肺腺癌患者预后生存关系

    A:TCGA肺腺癌数据集中HPRT1基因高表达与低表达生存曲线;B:多因素校正分析。

    Figure  2.  Relationship between HPRT1 gene expression and prognostic survival in patients with lung adenocarcinoma

    图  3  HPRT1基因表达与肺腺癌患者预后关系

    A:GEO中多组数据集分析HPRT1基因在肺腺癌中的预后特征;B:GSE13213(左)以及GSE67639(右)验证HPRT1基因与预后OS的关系。

    Figure  3.  Relationship between HPRT1 gene expression and prognosis of lung adenocarcinoma patients

    图  4  高表达、低表达HPRT1基因之间功能分析

    A:差异基因火山图;B:高表达的KEGG富集分析。

    Figure  4.  Functional enrichment analysis between high and low HPRT1 expression groups

    图  5  HPRT1高表达组免疫微环境特征分析

    A:IMER算法分析HPRT1基因不同表达组间B细胞含量对比;B:TIMER算法分析HPRT1基因不同表达组间CD4T细胞含量对比;C:CIBERSORT算法验证HPRT1基因不同表达组间不同B细胞含量;D:CIBERSORT算法验证HPRT1基因不同表达组间不同T细胞含量。

    Figure  5.  Characterization of the immune microenvironment in the HPRT1 high expression group

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出版历程
  • 收稿日期:  2024-04-02
  • 网络出版日期:  2024-07-06
  • 刊出日期:  2024-08-05

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