留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响

杨红秀 朱中山

杨红秀, 朱中山. 肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响[J]. 昆明医科大学学报, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
引用本文: 杨红秀, 朱中山. 肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响[J]. 昆明医科大学学报, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
Hongxiu YANG, Zhongshan ZHU. Effect of HPRT1 Gene Expression on Overall Survival of Patients with Lung Adenocarcinoma[J]. Journal of Kunming Medical University, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
Citation: Hongxiu YANG, Zhongshan ZHU. Effect of HPRT1 Gene Expression on Overall Survival of Patients with Lung Adenocarcinoma[J]. Journal of Kunming Medical University, 2024, 45(8): 17-23. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803

肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240803
基金项目: 湖南省自然科学基金科卫联合基金资助项目(2020JJ8080)
详细信息
    作者简介:

    杨红秀(1975~),女,湖南怀化人,医学学士,副主任护师,主要从事肿瘤专业护理与科研工作

    通讯作者:

    朱中山,E-mail:84059616@qq.com

  • 中图分类号: R734.2

Effect of HPRT1 Gene Expression on Overall Survival of Patients with Lung Adenocarcinoma

  • 摘要:   目的  探索HPRT1基因在肺腺癌中的表达特征、总生存率、功能激活以及免疫浸润中的影响。  方法  通过对TCGA肺腺癌数据以及多个GEO数据库中的肺腺癌数据进行挖掘分析,对比并验证HPRT1表达量与预后总生存(overall surival,OS)的关系,通过clusterProfiler分析HPRT1基因高表达组中上调基因的功能富集情况。且通过TIMER以及CIBERSORT算法计算肺腺癌中不同免疫细胞的浸润水平并对比在HPRT1高低表达组间的浸润程度差异。  结果  HPRT1在肺腺癌组织中表达量显著上调,且在TCGA中证明HPRT1基因高表达的患者预后OS更差(P < 0.01)。经过2个GEO数据集的验证同样发现HPRT1基因高表达表现为预后OS更差(GSE13213,P < 0.01;GSE67639,P < 0.001)。差异分析显示高表达的患者中有683个基因的表达量显著上调且这些上调基因的功能主要富集与p53以及细胞周期等癌症相关的信号通路。TIMER以及CIBERSORT算法进行的免疫细胞浸润程度分析发现在高表达差预后人群中B细胞以及CD4T细胞含量均更低(P < 0.05)。  结论  HPRT1基因表达量越高肺腺癌患者的总生存越差,且高表达患者的p53信号通路上调,B细胞以及CD4T细胞浸润程度显著下降。
  • 图  1  HPRT1基因在肺腺癌样本中表达情况

    A:HPRT1基因在肺腺癌组织与癌旁组织的差异;B:HPRT1基因表达量在患者肺腺癌不同分期样本中的对比;C:肺腺癌组织中HPRT1基因抗体(HPA006360)IHC定量表达。

    Figure  1.  HPRT1 gene expression in lung adenocarcinoma samples

    图  2  HPRT1基因表达与肺腺癌患者预后生存关系

    A:TCGA肺腺癌数据集中HPRT1基因高表达与低表达生存曲线;B:多因素校正分析。

    Figure  2.  Relationship between HPRT1 gene expression and prognostic survival in patients with lung adenocarcinoma

    图  3  HPRT1基因表达与肺腺癌患者预后关系

    A:GEO中多组数据集分析HPRT1基因在肺腺癌中的预后特征;B:GSE13213(左)以及GSE67639(右)验证HPRT1基因与预后OS的关系。

    Figure  3.  Relationship between HPRT1 gene expression and prognosis of lung adenocarcinoma patients

    图  4  高表达、低表达HPRT1基因之间功能分析

    A:差异基因火山图;B:高表达的KEGG富集分析。

    Figure  4.  Functional enrichment analysis between high and low HPRT1 expression groups

    图  5  HPRT1高表达组免疫微环境特征分析

    A:IMER算法分析HPRT1基因不同表达组间B细胞含量对比;B:TIMER算法分析HPRT1基因不同表达组间CD4T细胞含量对比;C:CIBERSORT算法验证HPRT1基因不同表达组间不同B细胞含量;D:CIBERSORT算法验证HPRT1基因不同表达组间不同T细胞含量。

    Figure  5.  Characterization of the immune microenvironment in the HPRT1 high expression group

  • [1] Tewari K S,Colombo N,Monk B J,et al. Pembrolizumab or placebo plus chemotherapy with or without bevacizumab for persistent,recurrent,or metastatic cervical cancer: Subgroup analyses from the KEYNOTE-826 randomized clinical trial[J]. JAMA Oncol,2024,10(2):185-192. doi: 10.1001/jamaoncol.2023.5410
    [2] Ma W,Zeng J,Montoya D J,et al. Labyrinthin expression is associated with poor prognosis in patients with non-small cell lung cancer[J]. Cancers (Basel),2023,15(3):924. doi: 10.3390/cancers15030924
    [3] Wang X S,Bai Y F,Verma V,et al. Randomized trial of first-line tyrosine kinase inhibitor with or without radiotherapy for synchronous oligometastatic EGFR-mutated non-small cell lung cancer[J]. J Natl Cancer Inst,2023,115(6):742-748. doi: 10.1093/jnci/djac015
    [4] Chen F,Byrd A L,Liu J,et al. Polycomb deficiency drives a FOXP2-high aggressive state targetable by epigenetic inhibitors[J]. Nat Commun,2023,14(1):336. doi: 10.1038/s41467-023-35784-x
    [5] John P,Sudandiradoss C. A comprehensive integrated gene network construction to explore the essential role of Notch 1 in lung adenocarcinoma (LUAD)[J]. J Biomol Struct Dyn,2024,1-13.
    [6] Xu H,Hu Y,Peng X,et al. Prediction of prognostic and immune therapy response in lung adenocarcinoma based on MHC-I-related genes[J]. Immunopharmacol Immunotoxicol,2024,46(1):93-106. doi: 10.1080/08923973.2023.2261146
    [7] Gurioli G,Conteduca V,Brighi N,et al. Circulating tumor cell gene expression and plasma AR gene copy number as biomarkers for castration-resistant prostate cancer patients treated with cabazitaxel[J]. BMC Med,2022,20(1):48. doi: 10.1186/s12916-022-02244-0
    [8] Miao J,Kang L,Lan T,et al. Identification of optimal reference genes in golden Syrian hamster with ethanol- and palmitoleic acid-induced acute pancreatitis using quantitative real-time polymerase chain reaction[J]. Animal Model Exp Med,2023,6(6):609-618. doi: 10.1002/ame2.12321
    [9] Chen L,He X,Yi S,et al. Six glycolysis-related genes as prognostic risk markers can predict the prognosis of patients with head and neck squamous cell carcinoma[J]. Biomed Res Int,2021,2021:8824195.
    [10] Gurioli G, Conteduca V, Brighi N, et al. Circulating tumor cell gene expression and plasma AR gene copy number as biomarkers for castration-resistant prostate cancer patients treated with cabazitaxel[J]. BMC Med,2022,20(1):48.
    [11] Goldman M J,Craft B,Hastie M,et al. Visualizing and interpreting cancer genomics data via the Xena platform[J]. Nat Biotechnol,2020,38(6):675-678. doi: 10.1038/s41587-020-0546-8
    [12] Tomida S,Takeuchi T,Shimada Y,et al. Relapse-related molecular signature in lung adenocarcinomas identifies patients with dismal prognosis[J]. J Clin Oncol,2009,27(17):2793-2799. doi: 10.1200/JCO.2008.19.7053
    [13] Gentles A J,Bratman S V,Diehn M,et al. Integrating tumor and stromal gene expression signatures with clinical indices for survival stratification of early-stage non-small cell lung cancer[J]. J Natl Cancer Inst,2015,107(10):djv211. doi: 10.1093/jnci/djv211
    [14] Uhlen M,Zhang C,Lee S,et al. A pathology atlas of the human cancer transcriptome[J]. Science,2017,357(6352):eaan2507. doi: 10.1126/science.aan2507
    [15] Yan Z,Wang Q,Lu Z,et al. OSluca: An interactive web server to evaluate prognostic biomarkers for lung cancer[J]. Front Genet,2020,11:420. doi: 10.3389/fgene.2020.00420
    [16] Yu G,Wang L G,Han Y,et al. clusterProfiler: An R package for comparing biological themes among gene clusters[J]. OMICS,2012,16(5):284-287. doi: 10.1089/omi.2011.0118
    [17] Wu M,Jiang L. Hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 6 is a prognostic biomarker and correlates with immune infiltrates in hepatocellular carcinoma[J]. Dig Dis Sci,2022,67(1):146-158. doi: 10.1007/s10620-021-06832-7
    [18] Chen B,Khodadoust M S,Liu C L,et al. Profiling tumor infiltrating immune cells with CIBERSORT[J]. Methods Mol Biol,2018,1711:243-259.
    [19] Mavridis K,Stravodimos K,Scorilas A. Quantified KLK15 gene expression levels discriminate prostate cancer from benign tumors and constitute a novel independent predictor of disease progression[J]. Prostate,2013,73(11):1191-201. doi: 10.1002/pros.22667
    [20] 朱中山,杨洲,江承川,等. 肺腺癌患者PLA2G1B表达情况与预后的相关性[J]. 昆明医科大学学报,2022,43(9):70-76.
  • [1] 杨晟强, 王平.  Hsp90抑制剂Ganetespib联合培美曲塞对肺腺癌细胞的影响, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240705
    [2] 沈旺寻, 杨银煜, 李灿伟, 杨金荣, 伍思婧, 赵华君, 陀晓宇.  ROR1在不同组织学分级浸润性肺腺癌中的表达与临床意义, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240509
    [3] 宋飞, 车佳音, 黄明, 徐丹, 李红阳, 李定坤, 向盈盈.  放射性125I粒子在肺腺癌EMT及临床治疗中的作用, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230101
    [4] 马诗淇, 丁毅, 李敏, 王梦慈, 张思宇, 冯树梅.  LINC00341通过MAPK通路抑制肺腺癌细胞增殖, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230403
    [5] 刘邦卿, 李剑锋, 刘晓辉, 张劲男, 梁金屏.  miR-196b靶向ERG促进肺腺癌的增殖和迁移, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20231023
    [6] 吴茂芳, 周永春, 蔡静静, 莫欣, 李瑛玮, 毛佳惠.  云南地区多结节肺腺癌EGFR突变及其临床意义, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220215
    [7] 赵华君, 潘国庆, 唐莹, 王智园, 赵晓玮, 陀晓宇.  ROR1在肺腺癌组织中的表达与气腔播散相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20221128
    [8] 朱中山, 杨洲, 江承川, 李小兵, 任斗, 黄橙, 张维薇, 李湘军, 赵顺利.  肺腺癌患者PLA2G1B表达情况与预后的相关性, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220912
    [9] 王应霞, 何琴, 王国芳, 张旋.  非小细胞肺癌中microRNA-21和EGFR的表达及意义, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20210818
    [10] 袁野, 常剑, 刘冬波, 姜保成.  混合型早期胃癌淋巴结转移情况及对预后的影响, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20210321
    [11] 段宏民, 陈楠, 杨永燕, 李云霞, 冯金象, 李航, 黄秀文, 吕东津, 张明, 赵玉涛.  安罗替尼对肺腺癌细胞株A549放射敏感性的影响及机制, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20210808
    [12] 马燕粉, 胡建, 张宁, 武倩, 王晓琴.  肺腺癌性与结核性胸腔积液患者凝血指标变化及异常模式, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20211021
    [13] 马国玉, 熊庆, 蒋国庆, 杨家甜, 木云珍.  基于生物信息学方法识别肺腺癌预后相关基因, 昆明医科大学学报.
    [14] 吴琪燕, 边革元, 程绘珺, 李娇霞, 王书廷, 黄照略.  肺腺癌预后因素及血清肿瘤标记物的诊断效能, 昆明医科大学学报.
    [15] 王吉妍, 段勇.  基于数据挖掘对冠心病诊断的研究进展, 昆明医科大学学报.
    [16] 朱中山, 严文辉, 李小兵, 杨洲, 白鹏.  200例肺腺癌脑转移患者驱动基因突变情况及预后关系, 昆明医科大学学报.
    [17] 王家祝, 刁先民, 康真, 常润生, 雷子发, 孙黎, 王兆敏, 曹娥, 李文辉.  云南个旧锡矿工人职业相关肺癌病理变化及97例鳞癌治疗与生存, 昆明医科大学学报.
    [18] 王华.  吉非替尼治疗晚期肺腺癌临床观察, 昆明医科大学学报.
    [19] 宣威肺腺癌xwlc-05和肺腺癌A549细胞株体外培养细胞活力的比较研究, 昆明医科大学学报.
    [20] 肺腺癌A549细胞中Nestin的表达, 昆明医科大学学报.
  • 加载中
图(5)
计量
  • 文章访问数:  519
  • HTML全文浏览量:  391
  • PDF下载量:  21
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2024-04-02
  • 网络出版日期:  2024-07-06
  • 刊出日期:  2024-08-05

目录

    /

    返回文章
    返回