高通量测序筛查特发性牙龈纤维瘤和正常牙龈外泌体miRNAs差异表达

殷顺会; 詹烨明; 贾凤梅; 冉丽权; 张明珠

高通量测序筛查特发性牙龈纤维瘤和正常牙龈外泌体miRNAs差异表达

昆明医科大学口腔医学院牙周科

基金项目:

云南省教育厅科学研究基金资助项目(V2018)；昆明医科大学创新团队建设基金资助项目(CXTD201711);昆明医科大学研究生创新基金资助项目(2018S172)；

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出版历程

摘要

摘要: 目的利用高通量测序技术筛选出特发性牙龈纤维瘤病牙龈成纤维细胞（IGF-GFs）与正常个体牙龈成纤维细胞（N-GFs）分泌的外泌体中差异表达的miRNAs,通过生物信息学分析预测靶基因和相关信号通路,进而为研究特发性牙龈纤维瘤病的发病机制奠定基础。方法原代培养IGF-GFs和N-GFs,收集细胞培养上清提取外泌体;使用IlluminaHiSeqTM2500测序平台对IGF-GFs和N-GFs来源外泌体中的miRNAs进行测序分析,使用Target Scan、miRDB、miRTar Base、miRWalk四款软件、KEGG数据库对部分表达差异显著的miRNAs进行靶基因预测和KEGG通路预测,并使用实时荧光定量PCR技术验证外泌体中差异性miRNAs的表达。结果 IGF-GFs和N-GFs来源的外泌体中miRNA分别占nc RNA中的0.74%、0.46%;高通量测序筛选出92个显著差异表达的miRNAs,挑选的12个miRNAs共预测出靶基因1304个以及多条信号通路,实时荧光定量PCR技术检测的3个miRNAs在IGF-GFs和N-GFs来源的外泌体中均有差异... 更多
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- 牙龈成纤维细胞 /
- 外泌体 /
- 外泌体miRNA /
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