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ANGPT1和TEK影响人类肿瘤进展的泛癌分析

杜国庆 刘志琴 李姚 史永华

杜国庆, 刘志琴, 李姚, 史永华. ANGPT1和TEK影响人类肿瘤进展的泛癌分析[J]. 昆明医科大学学报.
引用本文: 杜国庆, 刘志琴, 李姚, 史永华. ANGPT1和TEK影响人类肿瘤进展的泛癌分析[J]. 昆明医科大学学报.
Guoqing DU, Zhiqin LIU, Yao LI, Yonghua SHI. Pan-Cancer Analysis for the Effects of ANGPT1 and TEK on Human Tumor Progression[J]. Journal of Kunming Medical University.
Citation: Guoqing DU, Zhiqin LIU, Yao LI, Yonghua SHI. Pan-Cancer Analysis for the Effects of ANGPT1 and TEK on Human Tumor Progression[J]. Journal of Kunming Medical University.

ANGPT1和TEK影响人类肿瘤进展的泛癌分析

基金项目: 新疆地区高发疾病教育部重点实验室重点项目(2023A02)
详细信息
    作者简介:

    杜国庆(2001~),甘肃陇南人,在读本科生,主要从事宫颈癌肿瘤微环境中血管生成相关研究工作

    刘志琴(2001~),甘肃武威人,在读本科生,主要从事宫颈癌肿瘤微环境中血管生成相关研究。刘志琴与杜国庆对本文有同等贡献

    通讯作者:

    史永华,E-mail:z5826711@126.com

  • 中图分类号: R73-31

Pan-Cancer Analysis for the Effects of ANGPT1 and TEK on Human Tumor Progression

  • 摘要:   目的  探讨血管生成素1(angiopoietins-1,ANGPT1)及其受体TEK(tyrosine kinase)在泛癌中的表达、预后及免疫浸润的情况。  方法  应用TIMER2.0、Kaplan-Meier plotter、UALCAN等数据库分析ANGPT1及TEK在泛癌中的表达、预后;利用SangerBox3.0及R软件分析ANGPT1、TEK与肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)、微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)、免疫检查点(immune checkpoint,ICP)、免疫浸润的相关性;使用String数据库、GO与KEGG分析鉴定与ANGPT1和TEK相关的蛋白及调节通路。  结果  ANGPT1和TEK在多数肿瘤中低表达(P < 0.05)。ANGPT1、TEK低表达患者预后不良 (P < 0.05)。ANGPT1和TEK的表达水平与肾透明细胞癌、膀胱尿路上皮癌、乳腺浸润性癌等临床分期相关 (P < 0.05)。ANGPT1、TEK表达与肿瘤的TMB、MSI、ICP相关(P < 0.05),与免疫浸润正相关(P < 0.05)。与ANGPT1和TEK关系密切的基因有GRB2、PIK3R1、EGFR等,主要参与Grb2-EGFR、ERBB3:ERBB2、Shc-EGFR等复合物相关的生物学过程和功能,主要涉及ErbB信号通路。  结论  ANGPT1和TEK可能通过ErbB信号通路在肿瘤发生发展中起重要作用,有望成为多种癌症的潜在临床预后标志物。
  • 图  1  通过不同数据库分析ANGPT1与TEK在正常组织和不同肿瘤组织间的转录情况及蛋白表达量

    A:通过TIMER数据库分析ANGPT1在不同肿瘤组织中相对于正常组织中的表达水平。*P < 0.05;**P < 0.01; ***P < 0.001; B:通过TIMER数据库分析TEK在不同肿瘤组织中相对于正常组织中的表达水平。*P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001; C:通过UALCAN数据库分析ANGPT1在不同肿瘤组织的蛋白质组表达水平; D:通过UALCAN数据库分析TEK在不同肿瘤组织的蛋白质组表达水平。

    Figure  1.  The transcription and protein expression levels of ANGPT1 and TEK in normal tissues and different tumor tissues were analyzed by different databases

    图  2  通过Kaplan-Meier plotter数据库分析ANGPT1、TEK表达在不同癌症中的预后价值

    A:基于OS(总生存期)结果分析ANGPT1表达在不同肿瘤中的预后影响(P < 0.05);B:基于OS(总生存期)结果分析TEK表达在不同肿瘤中的预后影响(P < 0.05)。

    Figure  2.  Analysis of the prognostic value of ANGPT1 and TEK expression in different cancers by Kaplan-Meier plotter database

    图  3  ANGPT1和TEK在不同癌症类型中的基因免疫分析

    A:ANGPT1表达水平与不同癌症类型的TMB(Tumor mutation burden)的相关性; B:ANGPT1表达水平与不同癌症类型的MSI(Microsatellite instability)评分的相关性; C:ANGPT1表达水平与不同癌症类型的免疫检查点的相关性; D:TEK表达水平与不同癌症类型的TMB(Tumor mutation burden)的相关性; E:TEK表达水平与不同癌症类型的MSI(Microsatellite instability)评分的相关性; F:TEK表达水平与不同癌症类型的免疫检查点的相关性。

    Figure  3.  Gene immunoassays of ANGPT1 and TEK in different cancer types

    图  4  在不同癌症类型中ANGPT1和TEK的表达水平与免疫浸润细胞亚型的相关性分析(其中x轴为不同免疫细胞亚型,y轴为不同癌症类型,红色表示癌症和免疫细胞亚型之间的正相关。蓝色表示负相关。颜色越深,相关性越大。相关系数和P值显示在每个单元格中)

    A:在不同癌症类型中ANGPT1表达水平与免疫浸润细胞亚型的相关性(P < 0.05); B:在不同癌症类型中TEK表达水平与免疫浸润细胞亚型的相关性(P < 0.05)。

    Figure  4.  Correlation analysis of ANGPT1 and TEK expression levels with immune-infiltrating cell subtypes in different cancer types (The x-axis is for different immune cell subtypes,the y-axis is for different cancer types,and red indicates a positive correlation between cancer and immune cell subtype. Blue indicates a negative correlation. The darker the color,the greater the relevance. The correlation coefficient and P-value are displayed in each cell)

    图  5  ANGPT1和TEK相关基因的蛋白相互作用网络与富集通路分析

    A:通过TIMER数据库分析在不同癌症类型中ANGPT1对TEK表达量的影响; B:59个相关基因的蛋白质相互作用网络。通过STRING数据库检索得到的59个与ANGPT1和TEK相关的基因,利用Cytoscape软件将网络可视化,颜色节点代表已识别的蛋白质,从内到外,节点面积大小和颜色深浅程度代表节点的重要性强弱; C:ANGPT1和TEK相关基因GO分析的生物过程(BP)富集分析条目; D:ANGPT1和TEK相关基因GO分析的细胞组分(CC)富集分析条目; E:ANGPT1和TEK相关基因GO分析的分子功能(MF)富集分析条目; F:ANGPT1和TEK相关基因KEGG通路富集分析条目。

    Figure  5.  Analysis of protein interaction network and enrichment pathway of ANGPT1 and TEK-related genes

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出版历程
  • 收稿日期:  2023-12-10
  • 网络出版日期:  2024-05-19

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