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Car-R/Ceph-S的铜绿假单胞菌OprD基因突变分析

郑喜 马金珠 李琴春 高瑜 潘颖 宋贵波

郑喜, 马金珠, 李琴春, 高瑜, 潘颖, 宋贵波. Car-R/Ceph-S的铜绿假单胞菌OprD基因突变分析[J]. 昆明医科大学学报, 2023, 44(1): 7-11. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230121
引用本文: 郑喜, 马金珠, 李琴春, 高瑜, 潘颖, 宋贵波. Car-R/Ceph-S的铜绿假单胞菌OprD基因突变分析[J]. 昆明医科大学学报, 2023, 44(1): 7-11. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230121
Xi ZHENG, Jinzhu MA, Qinchun LI, Yu GAO, Ying PAN, Guibo SONG. Mutation Analysis of OprD Gene in Pseudomonas Aeruginosa with Car-R/ Ceph-S[J]. Journal of Kunming Medical University, 2023, 44(1): 7-11. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230121
Citation: Xi ZHENG, Jinzhu MA, Qinchun LI, Yu GAO, Ying PAN, Guibo SONG. Mutation Analysis of OprD Gene in Pseudomonas Aeruginosa with Car-R/ Ceph-S[J]. Journal of Kunming Medical University, 2023, 44(1): 7-11. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230121

Car-R/Ceph-S的铜绿假单胞菌OprD基因突变分析

doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230121
基金项目: 云南省高层次人才培养支持计划基金资助项目(YNWR-QNBJ-2020-261);云南省医学学科后备人才基金资助项目(H-2018075)
详细信息
    作者简介:

    郑喜(1992~),男,云南昭通人,理学学士,检验师,主要从事临床微生物检验工作

    通讯作者:

    宋贵波,E-mail:songgb1229@163.com

  • 中图分类号: R446.5

Mutation Analysis of OprD Gene in Pseudomonas Aeruginosa with Car-R/ Ceph-S

  • 摘要:     目的   研究对碳青霉烯类耐药而对头孢菌素敏感(carbapenem-resistant but cephalosporin-susceptible ,Car-R/Ceph-S)的铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中OprD基因的突变类型。    方法    对2021年1月至2021年3月昆明医科大学第一附属医院临床分离的10株对碳青霉烯类耐药而对头孢菌素敏感的铜绿假单胞菌进行分离培养;使用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测该表型铜绿假单胞菌中OprD基因的携带情况,并测序分析OprD基因的突变类型。    结果    10株菌株均显示出明显的OprD扩增条带,测序分析显示有以下突变类型,分别是移码突变2株、氨基酸替代突变8株、提前终止密码子2株、大片段缺失4株。    结论    对碳青霉烯类耐药而对头孢菌素敏感(Car-R/Ceph-S)的铜绿假单胞菌中OprD基因的突变类型呈多样化,点突变频率最高,还有大片段的缺失以及提前终止密码子。这些突变导致OprD结构发生改变,从而使得耐药现象的发生。
  • 图  1  10株铜绿假单胞菌OprD的扩增条带

    M:Marker;P1~P10分别表示10株菌株OprD的扩增条带。

    Figure  1.  Amplified bands of OprD of 10 Pseudomonas aeruginosa strains

    表  1  PA对12种抗生素的耐药率(n=10)

    Table  1.   Resistance rate of PA to 12 antibiotics (n=10)

    抗菌药物敏感 中介 耐药
    株数敏感率(%) 株数中介率(%) 株数耐药率(%)
    头孢他啶 10 100 0 0 0 0
    头孢吡肟 10 100 0 0 0 0
    亚胺培南 0 0 0 0 10 100
    美罗培南 0 0 0 0 10 100
    哌拉西林 8 80 2 20 0 0
    哌拉西林/他唑巴坦 9 90 1 10 0 0
    阿米卡星 10 100 0 0 0 0
    庆大霉素 8 80 1 10 1 10
    妥布霉素 8 80 0 0 2 20
    环丙沙星 3 30 0 0 7 70
    左氧氟沙星 3 30 1 10 6 60
    氨曲南 1 10 6 60 3 30
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    表  2  10株铜绿假单胞菌OprD基因突变分析

    Table  2.   Analysis of OprD gene mutation in 10 strains of Pseudomonas aeruginosa

    菌株突变类型突变特征
    P1 移码突变 533位点缺失1个碱基(C)
    P2 移码突变 175-176位点缺失2个碱基(AG)
    P3 氨基酸替代、提前终止密码子 D43N S57E S59R
    193-195位点TGGTGA
    P4 氨基酸替代 T103S K115T F170L E185Q P186G V189T Q310E A315G G425A
    P5 氨基酸替代、大片段缺失 S57E S59R V127L
    466-830位点大片段缺失
    P6 氨基酸替代、大片段缺失 S57E S59R V127L
    466-830位点大片段缺失
    P7 氨基酸替代、小片段缺失 D43N S57E S59R E202Q I210A E230K S240T N262T
    A267S A281G K296Q R310G V359L
    1116-1118位点缺1个氨基酸(GTC)
    P8 氨基酸替代、大片段缺失 S57E S59R V127L
    466-830位点大片段缺失
    P9 氨基酸替代、提前终止密码子 T103S K115T F170L E185Q P186G R310E A315G
    1249-1251位点TGGTGA
    P10 氨基酸替代、大片段缺失 S57E S59R V127L
    466-830位点大片段缺失
    下载: 导出CSV
  • [1] 中华医学会呼吸病学分会感染学组. 铜绿假单胞菌下呼吸道感染诊治专家共识[J]. 中华结核和呼吸杂志,2014,37(1):9-15. doi: 10.3760/cma.j.issn.1001-0939.2014.01.005
    [2] Lister P D,Wolter D J,Hanson N D. Antibacterial-resistant pseudomonas aeruginosa: Clinical impact and complex regulation of chromosomally encoded resistance mechanisms[J]. Clin Microbiol Rev,2009,22(4):582-610. doi: 10.1128/CMR.00040-09
    [3] 李绪定. 碳青霉烯类治疗铜绿假单胞菌肺炎的临床效果分析[J]. 医学信息,2018,31(13):134-136. doi: 10.3969/j.issn.1006-1959.2018.13.039
    [4] 胡付品,郭燕,朱德妹,等. 2019年CHINET三级医院细菌耐药监测[J]. 中国感染与化疗杂志,2020,20(3):233-243. doi: 10.16718/j.1009-7708.2020.03.001
    [5] Campana E H,Xavier D E,Petrolini F V,et al. Carbapenem-resistant and cephalosporin-susceptible: A worrisome phenotype among Pseudomonas aeruginosa clinical isolates in Brazil[J]. Braz J Infect Dis,2017,21(1):57-62. doi: 10.1016/j.bjid.2016.10.008
    [6] Clinical and laboratory standard institute.M100-S30 Performance standards for antimicrobial susceptibility testing: Thirtieth informational supplement[M]. Wayne PA: CLSI, 2020: 43-45.
    [7] 孙庆惠,杨白雪,巴兆粉,等. 铜绿假单胞菌亚胺培南中介菌株OprD基因分析[J]. 中国感染与化疗杂志,2017,17(2):177-181.
    [8] 李飞,李丽娟,梁德志,等. 耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药特征及其耐药机制的研究[J]. 分子诊断与治疗杂志,2019,11(2):101-106. doi: 10.3969/j.issn.1674-6929.2019.02.007
    [9] Lee J Y,Ko K S. OprD mutations and inactivation,expression of efflux pumps and AmpC,and metallo-β-lactamases in carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates from the republic of Korea[J]. Int J Antimicrob Agents,2012,40(2):168-172. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2012.04.004
    [10] González-Vázquez M C,Rocha-Gracia RDC,Carabarín-Lima A,et al. Location of OprD porin in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates[J]. APMIS,2021,129(4):213-224. doi: 10.1111/apm.13118
    [11] Sherrard Laura J,Wee Bryan A,Duplancic Christine,et al. Emergence and impact of oprD mutations in Pseudomonas aeruginosa strains in cystic fibrosis[J]. J Cyst Fibros,2022,21(1):e35-e43. doi: 10.1016/j.jcf.2021.03.007
    [12] Hirabayashi A,Kato D,Tomita Y,et al. Risk factors for and role of OprD protein in increasing minimal inhibitory concentrations of carbapenems in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa[J]. J Med Microbiol,2017,66(11):1562-1572. doi: 10.1099/jmm.0.000601
    [13] 陈丹娜,李飞,李丽娟,等. 东莞地区耐亚胺培南铜绿假单胞菌oprD基因分析[J]. 河北医学,2019,25(5):866-871. doi: 10.3969/j.issn.1006-6233.2019.05.39
    [14] 席红利,李娟,杨丽娜,等. 耐亚胺培南铜绿假单胞菌的耐药性特征及oprD基因突变分析[J]. 基因组学与应用生物学,2019,38(12):5684-5688.
  • [1] 张瑞婷, 阎斌, 李祖燕, 孙金敏, 姚锦.  诱导化疗时外周血原始细胞清除时间和初诊时白蛋白水平与急性髓系白血病患者基因突变及预后之间的关系, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240817
    [2] 普冬, 余婷婷, 李丽华, 张润武, 武昆利, 李冬玲.  昆明地区低病毒载量慢性乙肝患者血清高敏HBV DNA检测分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230114
    [3] 张冉, 杨洁, 冯恩梓, 袁晓凤, 王清.  甲状腺乳头状癌基因突变与其侵袭性相关性研究, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230223
    [4] 陈连勇, 茹浩浩, 杨星, 闫双群, 陈涛, 倪沁璇, 许琳.  云南省异烟肼耐药结核分枝杆菌katG和inhA基因突变特征, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20220803
    [5] 王云娟, 张艳亮, 徐秋月, 赵滢, 胡赵武, 苏洋.  2 376例地中海贫血基因筛查结果分析, 昆明医科大学学报. doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20210130
    [6] 蒋榆辉, 刘玲, 和灿琳, 李阳.  UGT1A1基因多态性与新生儿高胆红素血症的相关性, 昆明医科大学学报.
    [7] 陈静宜, 廖飞, 冯磊, 储从家, 田季野.  不同年龄段患者铜绿假单胞菌感染的临床分布与耐药性分析, 昆明医科大学学报.
    [8] 杨梅君, 潘兴, 叶吉明.  某院近5年耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌检出情况, 昆明医科大学学报.
    [9] 邓德耀, 袁文丽, 吴广娟, 陈弟, 李丽莉, 高宗鹰, 刘畅, 顾津伊.  创伤外科耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因型检测, 昆明医科大学学报.
    [10] 李琦.  云南337名非综合征型聋患者CIB2基因196C>T, 272T>C和297C>G突变分析, 昆明医科大学学报.
    [11] 钱璐, 边莉.  肺癌EGFR基因突变以及靶向药物耐药机制的研究进展, 昆明医科大学学报.
    [12] 王杨.  昆明地区铜绿假单胞菌ESBLs基因型和耐药性研究, 昆明医科大学学报.
    [13] 邓德耀.  重症监护病房耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因型的检测, 昆明医科大学学报.
    [14] 钟芳芳.  运用ARMS法检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变, 昆明医科大学学报.
    [15] 彭辉.  成人起病的青少年糖尿病研究进展, 昆明医科大学学报.
    [16] 卯建.  昆明医科大学第一附属医院铜绿假单胞菌感染的临床分布及耐药性分析, 昆明医科大学学报.
    [17] 李雪涛.  云南省部分聋生线粒体DNA 12S rRNA A1555G和C1494T的突变, 昆明医科大学学报.
    [18] 胡玉红.  耐亚胺培南铜绿假单胞菌的耐药分析, 昆明医科大学学报.
    [19] 刘玲.  UGT1A1基因多态性与昆明地区重症新生儿黄疸的遗传关联性研究, 昆明医科大学学报.
    [20] 蒋榆辉.  云南省迁延性新生儿黄疸与UGT 1A1基因多态性的遗传关联性研究, 昆明医科大学学报.
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出版历程
  • 收稿日期:  2022-10-15
  • 网络出版日期:  2022-12-23
  • 刊出日期:  2023-01-18

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