<i>EGFR</i>基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌的关联性

李盈甫; 郭妮; 罗正光; 邢安灏; 李太福; 马千里

EGFR基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌的关联性

1.
昆明医科大学第一附属医院干疗科，云南昆明　650032
2.
保山中医药高等专科学校，云南保山　678000
3.
昆明医科大学第三附属医院胸外科，云南昆明　650118
4.
安宁市太平卫生院综合科，云南安宁　650301

详细信息

中图分类号: R734.2
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出版历程

Correlation of EGFR Gene Polymorphisms with Non-small Cell Lung Cancer in Yunnan Han Population

1.
Department of Geriatrics，The 1st Affiliated Hospital of Kunming Medical University，Kunming Yunnan 650032
2.
Baoshan College of Traditional Chinese Medicine，Baoshan Yunnan 678000
3.
Department of Thoracic Surgery，The 3rd Affiliated Hospital of Kunming Medical University，Kunming Yunnan 650118
4.
Anning Taiping Health Center，Anning Yunnan 650301，China

摘要

摘要: 目的评估云南汉族人群中表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor，EGFR）基因多态性与非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer，NSCLC）的相关性。方法本研究共纳入407例NSCLC患者及526例健康对照者。采用TaqMan探针法对EGFR上的5个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）位点（rs1050171、rs2072454、rs2227983、rs1140475和rs2293347）进行基因分型检测，并分析5个SNPs位点与NSCLC以及病理类型的相关性。结果在显性模式下，rs2072454位点的C/T-T/T相对于C/C可能是NSCLC发生的风险因素（P = 0.004；OR = 1.50，95% CI 1.14～1.96）。在鳞状细胞癌（squamous cell carcinoma，SCC）组与对照组间基因型频率差异有统计学意义（P = 0.007），但等位基因频率经过Bonferroni校正后无差异（P > 0.01）；在显性模式下，该位点的C/T-T/T相对于C/C来说是NSCLC中腺癌（adenocarcinoma，AC）发生的风险因素（P = 0.002；OR = 1.86，95% CI 1.24～2.80）。在隐性模式下，rs1050171位点携带A/A基因型的个体患鳞癌的风险显著升高（P = 0.006，OR = 2.66，95% CI 1.33～5.33）。显性模式下，rs2227983位点的A/G-G/G相对于A/A来说是NSCLC中SCC发生的风险因素（P = 0.007；OR = 1.83，95% CI 1.15～2.89）。结论 EGFR基因SNP位点rs2072454、rs1050171、rs2227983可能与云南汉族人群NSCLC发生风险相关，且与病理类型相关。
- 非小细胞肺癌 /
- EGFR基因 /
- 单核苷酸多态性 /
- 关联性
Abstract: Objective To investigate the correlation between the epidermal growth factor receptor （EGFR） gene polymorphisms and non-small cell lung cancer （NSCLC） in Yunnan Han population. Methods A total of 407 NSCLC patients and 526 healthy controls were included. Five SNPs （rs1050171, rs2072454, rs2227983, rs1140475 and rs2293347） in EGFR were genotyped using TaqMan assay. The association between SNPs and NSCLC, as well as pathological types, were analyzed. Results In dominant mode, rs2072454 C/T-T/T may be a risk factor for NSCLC （P = 0.004; OR = 1.50, 95% CI 1.14～1.96）. There was a significant difference in genotype frequency between the SCC group and the control group （P = 0.007）, but no difference in allele frequency after Bonferroni correction （P > 0.01）; In the dominant mode, C/T-T/T at this locus relative to C/C was a risk for AC （P = 0.002; OR = 1.86, 95% CI 1.24～2.80）. rs1050171 A/A had a significantly higher risk of SCC in recessive mode （P = 0.006, OR = 2.66, 95% CI 1.33～5.33）. In dominant mode, rs2227983 A/G-G/G/G was a risk factor for the development of SCC relative to A/A （P = 0.007; OR = 1.83, 95% CI 1.15～2.89）. Conclusion The SNPs rs2072454, rs1050171 and rs2227983 in EGFR gene may be associated with the risk of NSCLC development as well as the type of pathology in Yunnan Han population.
- Non-small cell lung cancer /
- EGFR /
- Single nucleotide polymorphism /
- Correlation

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根据2020年全球癌症统计数据，肺癌是最常见的癌症类型，估计有220万新发病例和180万死亡病例^[1]。在按性别分类的癌症死亡人数统计中，肺癌是主要的致死癌症之一，其死亡人数占全球癌症死亡人数的40%^[2]。NSCLC是肺癌最常见的亚型，占所有类型的85%～90%^[3]。肺癌的发生和进展是一个多步骤、多因素的过程，其中涉及遗传、表观遗传和环境间的相互作用^[4]。众多驱动因子参与NSCLC形成、发展的生物学过程，例如EGFR、间变淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK）和鼠类肉瘤病毒癌基因（kirsten rat sarcoma viral oncogene，KRAS）等突变。

EGFR是受体酪氨酸激酶家族成员ErbB的家族成员，是原癌基因C-erb-1（HER-1）编码表达的产物^[5]。EGFR与配体特异性结合后，会导致胞内酪氨酸残基发生磷酸化。该生物过程将触发一系列级联放大反应，持续激活Akt和STAT3等EGFR通路的下游分子，进一步启动下游信号通路，促进细胞生长分裂、侵袭转移及凋亡抑制等生物学效应，从而推动NSCLC的形成和发展^[6−7]。研究表明，EGFR基因经常在癌细胞中发生扩增或突变，这与癌症的发展有关^[8]。同时EGFR是NSCLC最常见的驱动基因之一^[9]，数据显示至少50%的亚裔NSCLC患者的EGFR基因会发生活化突变^[10]。部分研究结果表明，影响EGFR表达和活性的突变理论上可能会改变肺癌的风险，这些突变或多态性可能增加了对肺癌的易感性^[11−12]。Jou等发现EGFR基因中的SNP位点与肺癌显著相关，并在台湾地区肺癌患者的疾病发展中起着重要作用^[13]。关于EGFR多态性的研究表明，不同人群中EGFR基因的突变类型和频率可能存在差异，需要对不同群体进行更全面的研究。目前，关于EGFR与云南汉族人群NSCLC的相关性分析尚未见报道。

本研究选取EGFR基因上的5个tagSNPs位点（rs1050171、rs2072454、rs2227983、rs1140475和rs2293347），研究其与云南汉族人群中NSCLC的相关性，并在此基础上，进一步分析这5个tagSNPs位点与不同病理类型NSCLC的相关性。

1. 材料与方法

1.1 研究对象

所有研究对象均严格遵循知情同意原则完成样本采集。研究组严格纳入407例经手术或病理活检确诊的非小细胞肺癌患者，同时匹配同期在该院完成系统体检的526例健康人群作为对照组。全部研究对象均限定为云南地区长期居住、无亲缘关系的汉族个体。病例排除标准包含：（1）采样前接受过放射治疗或化学药物治疗等抗肿瘤辅助治疗；（2）合并其他恶性肿瘤或伴有心血管疾病、糖尿病等慢性基础疾病；（3）临床诊疗信息不完整者。本研究方案已通过昆明医科大学第三附属医院伦理审查委员会审核批准（KYCS202197）。

1.2 基因组DNA提取

使用血液DNA提取试剂盒（QIAamp DNA Blood Mini Kit，德国QIAGEN）提取全血中DNA，DNA浓度及纯度用分光光度计（Multiskan GO，美国Thermo Fisher Scientific）进行检测，DNA样本保存于-80 ℃冰箱。

1.3 基因分型

本研究采用TaqMan探针法进行基因分型分析。实验所用TaqMan探针（TaqMan SNP Genotyping Assays）及配套分型试剂（TaqMan Genotyping Master Mix）均采购自美国Applied Biosystems公司，涉及的5个SNP位点探针对应编号分别为：rs1050171（C___2678675_20）、rs2072454（C___2678638_1_）、rs2227983 （C__16170352_20）、rs1140475 （C__15918519_10）及rs2293347（C__15970737_20）。各SNP位点的基因分型实验严格遵循实验室前期构建的标准化检测体系^[14]。为保障数据可靠性，随机抽取5%实验样本送至擎科生物公司进行测序验证，确保各SNP位点分型结果准确无误。

1.4 统计学分析

本研究采用IBM SPSS Statistics 26.0软件进行统计学分析，通过独立样本t检验评估癌症组与对照组的年龄差异，运用卡方检验（χ²）比较两组性别分布的显著性差异。为验证对照组样本的代表性，实施Hardy-Weinberg平衡检验（HWE），以上统计分析显著性阈值设定为P < 0.05。针对5个SNP位点的遗传特征，进一步利用SHEsis在线平台（http://analysis.biox.cn/myAnalysis.php）进行等位基因与基因型频率的组间比较。通过SNPStats分析系统（https://www.snpstats.net/start.htm）系统评估共显性、显性、隐性、超显性及逻辑累加五种遗传模型，基于赤池信息量准则（Akaike information criterion，AIC）和贝叶斯信息量准则（Bayesian information criterion，BIC）的双重优化策略，选取各模型中AIC与BIC最小值对应的遗传模型作为最优解。为控制多重检验误差，采用Bonferroni校正法将显著性阈值严格设定为P < 0.01（0.05/n，n = 5），确保统计学分析的可靠性。

2. 结果

2.1 研究对象

本次研究共纳入933例受试者，涵盖407例NSCLC患者和526例健康对照者。NSCLC组平均年龄为56.58 ± 11.77岁，男性350例，女性176例，包含262例AC与145例SCC；临床资料显示，NSCLC组中（Ⅰ + Ⅱ期）157例，（Ⅲ期 + IV期）250例。对照组平均年龄为55.91 ± 10.64岁，男性273例，女性134例，两组在性别构成及年龄分布上均无显著差异（P > 0.05）。HWE检验结果显示，EGFR基因的5个SNP位点的各基因型在对照组中的分布均遗传平衡定律（HWE，P > 0.05），表明本研究中所选取的样本具有群体代表性，见表1。

表 1 EGFR基因5个SNP位点在NSCLC组和对照组间基因型频率分布 [n（%）]

Table 1. Genotype frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene between the NSCLC group and the control group [n（%）]

SNPs	基因型	对照组	NSCLC组	χ²	P	HWE，P
rs1050171	AA	15 （2.9）	24 （5.9）	5.575	0.062	0.985
	AG	148 （28.1）	117 （28.7）
	GG	363 （69.0）	266 （65.4）
rs2072454	CC	214 （40.7）	128 （31.4）	9.118	0.01	0.999
	CT	243 （46.2）	225 （55.3）
	TT	69 （13.1）	54 （13.3）
rs2227983	AA	155 （29.5）	98 （24.1）	3.628	0.163	0.919
	AG	260 （49.4）	222 （54.5）
	GG	111 （21.1）	87 （21.4）
rs1140475	CC	471 （89.5）	368 （90.4）	1.185	0.553	0.053
	CT	51 （9.7）	38 （9.3）
	TT	4 （0.8）	1 （0.2）
rs2293347	CC	266 （50.6）	230 （56.5）	4.49	0.106	0.125
	CT	226 （43.0）	147 （36.1）
	TT	34 （6.5）	30 （7.4）
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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2.2 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC的相关性

通过卡方检验系统分析了EGFR基因5个SNP位点（rs1050171、rs2072454、rs2227983、rs1140475、rs2293347）在NSCLC组与对照组中的基因型分布差异。研究数据表明，rs2072454位点基因型频率在两组间呈现显著性差异（P = 0.010），但经Bonferroni多重校正后与校正阈值（P < 0.01）持平，失去统计学显著性。其余4个SNP位点的基因型分布在病例组与对照组间均未达到显著性水平（P > 0.01），见表1。进一步对各SNP位点在NSCLC组与对照组间的等位基因频率分布进行分析，结果显示，rs2072454等位基因C在NSCLC组中的分布频率显著低于对照组（P = 0.039；OR = 0.82，95% CI 0.68～0.99），提示C等位基因可能与NSCLC风险降低存在潜在关联，经Bonferroni多重校正（显著性阈值P < 0.01）后，该差异不再具有统计学意义。rs1050171、rs2227983、rs1140475及rs2293347位点在两组间的等位基因频率分布在校正前后均未呈现显著性差异（P > 0.01），见表2。通过随机抽样验证发现5个SNP位点的测序结果与基因分型完全一致，典型验证图谱见图1。

表 2 EGFR基因5个SNP位点在NSCLC组和对照组间等位基因频率分布 [n（%）]

Table 2. Allele frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene between the NSCLC group and the control group [n（%）]

SNPs	等位基因	对照组	NSCLC组	OR （95% CI）	χ²	P
rs1050171	A	178 （16.9）	165 （20.3）	1.25 （0.99～1.58）	3.433	0.064
	G	874 （83.1）	649 （79.7）	1.25 （0.99～1.58）	3.433	0.064
rs2072454	C	671 （63.8）	481 （59.1）	0.82 （0.68～0.99）	4.277	0.039
	T	381 （36.2）	333 （40.9）	0.82 （0.68～0.99）	4.277	0.039
rs2227983	A	570 （54.2）	418 （51.4）	0.89 （0.74～1.07）	1.476	0.224
	G	482 （45.8）	396 （48.6）	0.89 （0.74～1.07）	1.476
rs1140475	C	993 （94.4）	774 （95.1）	1.15 （0.76～1.74）	0.44	0.507
	T	59 （5.6）	40 （4.9）	1.15 （0.76～1.74）	0.44
rs2293347	C	758 （72.1）	607 （74.6）	1.14 （0.92～1.40）	1.48	0.224
	T	294 （27.9）	207 （25.4）	1.14 （0.92～1.40）	1.48
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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图 1 EGFR基因的5个SNP位点测序图

A：rs1050171测序峰图；B：rs2072454测序峰图；C：rs2227983测序峰图；D：rs1140475测序峰图；E：rs2293347测序峰图。

Figure 1. Sequencing of 5 SNPs in EGFR gene

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2.3 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC相关性的遗传模型分析

遗传模型分析结果显示，显性模式是rs2072454位点的最优遗传模型（AIC = 1273.7，BIC = 1283.4），在该模式下，C/T-T/T相对于C/C可能是NSCLC发生的风险因素（P = 0.004；OR = 1.50，95% CI 1.14～1.96）。其余位点（rs1050171、rs2227983、rs1140475、rs2293347）在所有遗传模型中均未发现显著关联（P > 0.01），见表2。

表 3 EGFR基因5个SNP位点在NSCLC组和对照组相关性的遗传模型分析 [n（%）]

Table 3. The inheritance analysis of five SNPs between NSCLC and control group [n（%）]

SNPs	遗传模型	基因型	对照组	NSCLC组	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs1050171	共显性	G/G	363 （69.0）	266 （65.4）	1	0.06	1278.7	1293.2
		A/G	148 （28.1）	117 （28.7）	1.08 （0.81～1.44）
		A/A	15 （2.9）	24 （5.9）	2.18 （1.12～4.24）
	显性	G/G	363 （69.0）	266 （65.4）	1	0.24	1280.8	1290.5
		A/G-A/A	163 （31.0）	141 （34.6）	1.18 （0.90～1.55）	0.24	1280.8	1290.5
	隐性	G/G-A/G	511 （97.2）	383 （94.1）	1	0.02	1276.9	1286.6
		A/A	15 （2.8）	24 （5.9）	2.13 （1.10～4.12）	0.02	1276.9	1286.6
	超显性	G/G-A/A	378 （71.9）	290 （71.2）	1	0.84	1282.2	1291.8
		A/G	148 （28.1）	117 （28.8）	1.03 （0.77～1.37）	0.84	1282.2	1291.8
	逻辑累加	---	---	---	1.23 （0.98～1.55）	0.07	1278.9	1288.6
rs2072454	共显性	C/C	214 （40.7）	128 （31.4）	1	0.01	1275	1289.5
		C/T	243 （46.2）	225 （55.3）	1.55 （1.16～2.06）
		T/T	69 （13.1）	54 （13.3）	1.31 （0.86～1.99）
	显性	C/C	214 （40.7）	128 （31.4）	1	0.004^*	1273.7	1283.4
		C/T-T/T	312 （59.3）	279 （68.6）	1.50 （1.14～1.96）	0.004^*	1273.7	1283.4
	隐性	C/C-C/T	457 （86.9）	353 （86.7）	1	0.95	1282.2	1291.9
		T/T	69 （13.1）	54 （13.3）	1.01 （0.69～1.48）	0.95	1282.2	1291.9
	超显性	C/C-T/T	283 （53.8）	182 （44.7）	1	0.006^*	1274.6	1284.3
		C/T	243 （46.2）	225 （55.3）	1.44 （1.11～1.87）	0.006^*	1274.6	1284.3
	逻辑累加	---	---	---	1.24 （1.02～1.50）	0.03	1277.6	1287.3
rs2227983	共显性	A/A	155 （29.5）	98 （24.1）	1	0.16	1280.5	1295.1
		A/G	260 （49.4）	222 （54.5）	1.35 （0.99～1.84）
		G/G	111 （21.1）	87 （21.4）	1.24 （0.85～1.81）
	显性	A/A	155 （29.5）	98 （24.1）	1	0.07	1278.8	1288.5
		A/G-G/G	371 （70.5）	309 （75.9）	1.32 （0.98～1.77）	0.07	1278.8	1288.5
	隐性	A/A-A/G	415 （78.9）	320 （78.6）	1	0.92	1282.2	1291.9
		G/G	111 （21.1）	87 （21.4）	1.02 （0.74～1.39）	0.92	1282.2	1291.9
	超显性	A/A-G/G	266 （50.6）	185 （45.5）	1	0.12	1279.8	1289.5
		A/G	260 （49.4）	222 （54.5）	1.23 （0.95～1.59）	0.12	1279.8	1289.5
	逻辑累加	---	---	---	1.13 （0.93～1.36）	0.22	1280.7	1290.3
rs1140475	共显性	C/C	471 （89.5）	368 （90.4）	1	0.52	1282.9	1297.4
		C/T	51 （9.7）	38 （9.4）	0.95 （0.61～1.48）
		T/T	4 （0.8）	1 （0.2）	0.32 （0.04～2.87）
	显性	C/C	471 （89.5）	368 （90.4）	1	0.66	1282	1291.7
		C/T-T/T	55 （10.5）	39 （9.6）	0.91 （0.59～1.40）	0.66	1282	1291.7
	隐性	C/C-C/T	522 （99.2）	406 （99.8）	1	0.26	1280.9	1290.6
		T/T	4 （0.8）	1 （0.2）	0.32 （0.04～2.88）	0.26	1280.9	1290.6
	超显性	C/C-T/T	475 （90.3）	369 （90.7）	1	0.85	1282.2	1291.8
		C/T	51 （9.7）	38 （9.3）	0.96 （0.62～1.49）	0.85	1282.2	1291.8
	逻辑累加	---	---	---	0.88 （0.59～1.31）	0.52	1281.8	1291.4
rs2293347	共显性	C/C	266 （50.5）	230 （56.5）	1	0.11	1279.7	1294.2
		C/T	226 （43.0）	147 （36.1）	0.75 （0.57～0.99）
		T/T	34 （6.5）	30 （7.4）	1.02 （0.61～1.72）
	显性	C/C	266 （50.6）	230 （56.5）	1	0.07	1278.9	1288.6
		C/T-T/T	260 （49.4）	177 （43.5）	0.79 （0.61～1.02）	0.07	1278.9	1288.6
	隐性	C/C-C/T	492 （93.5）	377 （92.6）	1	0.59	1281.9	1291.6
		T/T	34 （6.5）	30 （7.4）	1.15 （0.69～1.92）	0.59	1281.9	1291.6
	超显性	C/C-T/T	300 （57.0）	260 （63.9）	1	0.03	1277.7	1287.4
		C/T	226 （43.0）	147 （36.1）	0.75 （0.58～0.98）	0.03	1277.7	1287.4
	逻辑累加	---	---	---	0.88 （0.71～1.08）	0.22	1280.7	1290.4
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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2.4 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC病理类型的相关性

为明确所选SNP位点与不同NSCLC病理类型的潜在关联，进一步按照病理类型进行分层分析。基因频率分析显示，SCC组中rs2072454位点CC基因型频率较对照组显著降低（P = 0.007）。另外，rs1050171位点基因型AA在AC组中的频率较对照组升高（P = 0.014），但经Bonferroni多重校正后该差异无统计学意义（P > 0.01）。rs2227983、rs1140475、rs2293347三个位点的基因型分布在AC组、SCC组与对照组之间分布均无差异（P > 0.01），见表4。等位基因频率分布结果显示，rs1050171等位基因A在AC组中的频率高于对照组（P = 0.03；OR = 1.35，95% CI 1.04～1.76），rs2072454等位基因C在SCC组中的频率低于对照组（P = 0.02；OR = 0.74，95% CI 0.57～0.96），但经过Bonferroni校正后差异均无统计学意义。其余位点等位基因频率在两组病例与对照组间均未呈现显著差异（P > 0.01），见表5。

表 4 EGFR基因中5个SNP位点在AC组、SCC组和对照组间基因型频率分布 [n（%）]

Table 4. Genotype frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene among AC，SCC and control groups [n（%）]

SNPs	基因型	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组		SCC组vs对照组
SNPs	基因型	对照组	AC组	SCC组	χ²	P	χ²	P
rs1050171	AA	15 （2.9）	19 （7.3）	5 （3.4）	8.483	0.014	0.197	0.906
	AG	148 （28.1）	75 （28.6）	42 （29.0）
	GG	363 （69.0）	168 （64.1）	98 （67.6）
rs2072454	CC	214 （40.7）	89 （34.0）	39 （26.9）	3.749	0.153	9.756	0.008^*
	CT	243 （46.2）	139 （53.1）	86 （59.3）
	TT	69 （13.1）	34 （13.0）	20 （13.8）
rs2227983	AA	155 （29.5）	71 （27.1）	27 （18.6）	0.491	0.782	8.117	0.017
	AG	260 （49.4）	133 （50.8）	89 （61.4）
	GG	111 （21.1）	58 （22.1）	29 （20.0）
rs1140475	CC	471 （89.5）	238 （90.8）	130 （89.6）	2.077	0.354	0.008	0.996
	CT	51 （9.7）	24 （9.2）	14 （9.7）
	TT	4 （0.8）	0 （0.0）	1 （0.7）
rs2293347	CC	266 （50.5）	150 （57.3）	80 （55.2）	4.499	0.106	1.187	0.552
	CT	226 （43.0）	92 （35.1）	55 （37.9）
	TT	34 （6.5）	20 （7.6）	10 （6.9）
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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表 5 EGFR基因5个SNP位点在在AC组、SCC组和对照组间等位基因频率分布 [n（%）]

Table 5. Allele frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene among the AC group，SCC group，and control group [n（%）]

SNPs	等位基因	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组			SCC组vs对照组
SNPs	等位基因	对照组	AC组	SCC组	χ²	P	OR （95% CI）	χ²	P	OR （95% CI）
rs1050171	A	178 （16.9）	113 （21.6）	52 （17.9）	0.025	1.35 （1.04～1.76）		0.164	0.686	1.07 （0.76～1.51）
	G	874 （83.1）	411 （78.4）	238 （82.1）	0.025	1.35 （1.04～1.76）		0.164	0.686	1.07 （0.76～1.51）
rs2072454	C	671 （63.8）	317 （60.5）	164 （56.6）	0.204	0.87 （0.70～1.08）		5.057	0.025	0.74 （0.57～0.96）
	T	381 （36.2）	207 （39.5）	126 （43.4）	0.204	0.87 （0.70～1.08）		5.057	0.025	0.74 （0.57～0.96）
rs2227983	A	570 （54.2）	275 （52.5）	143 （49.3）	0.523	0.93 （0.76～1.15）		2.167	0.141	0.82 （0.63～1.07）
	G	482 （45.8）	249 （47.5）	147 （50.7）	0.523	0.93 （0.76～1.15）		2.167	0.141	0.82 （0.63～1.07）
rs1140475	C	993 （94.4）	500 （95.4）	274 （94.5）	0.389	1.24 （0.76～2.01）		0.004	0.952	1.02 （0.58～1.80）
	T	59 （5.6）	24 （4.6）	16 （5.5）	0.389	1.24 （0.76～2.01）		0.004	0.952	1.02 （0.58～1.80）
rs2293347	C	758 （72.1）	392 （74.8）	215 （74.1）	0.246	1.15 （0.91～1.46）		0.495	0.481	1.11 （0.83～1.50）
rs2293347	T	294 （27.9）	132 （25.2）	75 （25.9）	0.246	1.15 （0.91～1.46）		0.495	0.481	1.11 （0.83～1.50）
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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2.5 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC病理类型相关性的遗传模型分析

遗传模型分析结果显示，rs1050171位点在隐性模型下A/A基因型与AC风险显著相关（OR = 2.66，95% CI 1.33～5.33，P = 0.006），且该模型拟合优度最佳（AIC = 998.6，BIC = 1007.9），提示隐性遗传为最优遗传模型。rs2072454位点在显性模型中C/T-T/T基因型显著增加SCC风险（OR = 1.86，95% CI 1.24～2.80，P = 0.002），显性模式主导风险关联（AIC = 694.9，BIC = 703.9）。rs2227983位点的最优遗传模型同样为显性模式（AIC = 1005.7，BIC = 1015.1），该模型下SCC组中A/G-G/G基因型频率显著高于对照组（P = 0.007；OR = 1.83，95% CI 1.15～2.89）。其余SNP位点与NSCLC发病风险未呈现统计学显著关联（P > 0.01），见表6。

表 6 EGFR基因5个SNP位点在AC组、SCC组和对照组相关性的遗传模型分析 [n（%）]

Table 6. The inheritance analysis of five SNPs among AC，SCC and control groups [n（%）]

SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组				SCC组vs对照组
SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	OR （95% CI）	P	AIC	BIC	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs1050171	共显性	G/G	363 （69.0）	168 （64.1）	98 （67.5）	1	0.02	1000.3	1014.3	1	0.91	706.2	719.8
		A/G	148 （28.1）	75 （28.6）	42 （29.0）	1.09 （0.79～1.53）				1.05 （0.70～1.58）
		A/A	15 （2.8）	19 （7.3）	5 （3.5）	2.74 （1.36～5.52）				1.23 （0.44～3.48）
	显性	G/G	363 （69.0）	168 （64.1）	98 （67.6）	1	0.17	1004.3	1013.7	1	0.74	704.3	713.3
		A/G-A/A	163 （31.0）	94 （35.9）	47 （32.4）	1.25 （0.91～1.70）	0.17	1004.3	1013.7	1.07 （0.72～1.58）	0.74	704.3	713.3
	隐性	G/G-A/G	511 （97.2）	243 （92.8）	140 （96.5）	1	0.006^*	998.6	1007.9	1	0.71	704.3	713.3
		A/A	15 （2.8）	19 （7.2）	5 （3.5）	2.66 （1.33～5.33）	0.006^*	998.6	1007.9	1.22 （0.43～3.41）	0.71	704.3	713.3
	超显性	G/G-A/A	378 （71.9）	187 （71.4）	103 （71.0）	1	0.89	1006.2	1015.5	1	0.84	704.4	713.4
		A/G	148 （28.1）	75 （28.6）	42 （29.0）	1.02 （0.74～1.42）	0.89	1006.2	1015.5	1.04 （0.69～1.56）	0.84	704.4	713.4
	逻辑累加	---	---	---	---	1.33 （1.03～1.72）	0.03	1001.6	1010.9	1.07 （0.76～1.51）	0.69	704.3	713.3
rs2072454	共显性	C/C	214 （40.7）	89 （34.0）	39 （26.9）	1	0.15	1004.5	1018.5	1	0.006^*	696.4	709.9
		C/T	243 （46.2）	139 （53.0）	86 （59.3）	1.38 （1.00～1.90）				1.94 （1.28～2.96）
		T/T	69 （13.1）	34 （13.0）	20 （13.8）	1.18 （0.73～1.91）				1.59 （0.87～2.91）
	显性	C/C	214 （40.7）	89 （34.0）	39 （26.9）	1	0.07	1002.9	1012.2	1	0.002^*	694.9	703.9
		C/T-T/T	312 （59.3）	173 （66.0）	106 （73.1）	1.33 （0.98～1.82）	0.07	1002.9	1012.2	1.86 （1.24～2.80）	0.002^*	694.9	703.9
	隐性	C/C-C/T	457 （86.9）	228 （87.0）	125 （86.2）	1	0.96	1006.2	1015.6	1	0.83	704.4	713.4
		T/T	69 （13.1）	34 （13.0）	20 （13.8）	0.99 （0.64～1.53）	0.96	1006.2	1015.6	1.06 （0.62～1.81）	0.83	704.4	713.4
	超显性	C/C-T/T	283 （53.8）	123 （47.0）	59 （40.7）	1	0.07	1002.9	1012.3	1	0.005^*	696.6	705.6
		C/T	243 （46.2）	139 （53.0）	86 （59.3）	1.32 （0.98～1.77）	0.07	1002.9	1012.3	1.70 （1.17～2.47）	0.005^*	696.6	705.6
	逻辑累加	---	---	---	---	1.16 （0.93～1.44）	0.2	1004.5	1013.9	1.37 （1.05～1.80）	0.02	699.2	708.2
rs2227983	共显性	A/A	155 （29.5）	71 （27.1）	27 （18.6）	1	0.78	1007.7	1021.7	1	0.02	698	711.5
		A/G	260 （49.4）	133 （50.8）	89 （61.4）	1.12 （0.79～1.58）				1.97 （1.22～3.16）
		G/G	111 （21.1）	58 （22.1）	29 （20.0）	1.14 （0.75～1.74）				1.50 （0.84～2.67）
	显性	A/A	155 （29.5）	71 （27.1）	27 （18.6）	1	0.49	1005.7	1015.1	1	0.007	697.2	706.3
		A/G-G/G	371 （70.5）	191 （72.9）	118 （81.4）	1.12 （0.81～1.56）	0.49	1005.7	1015.1	1.83 （1.15～2.89）	0.007	697.2	706.3
	隐性	A/A-A/G	415 （78.9）	204 （77.9）	116 （80.0）	1	0.74	1006.1	1015.4	1	0.77	704.3	713.4
		G/G	111 （21.1）	58 （22.1）	29 （20.0）	1.06 （0.74～1.52）	0.74	1006.1	1015.4	0.93 （0.59～1.48）	0.77	704.3	713.4
	超显性	A/A-G/G	266 （50.6）	129 （49.2）	56 （38.6）	1	0.72	1006.1	1015.4	1	0.01	697.9	706.9
		A/G	260 （49.4）	133 （50.8）	89 （61.4）	1.05 （0.78～1.42）	0.72	1006.1	1015.4	1.63 （1.12～2.37）	0.01	697.9	706.9
	逻辑累加	---	---	---	---	1.07 （0.87～1.32）	0.52	1005.8	1015.2	1.23 （0.94～1.60）	0.13	702.2	711.2

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表 6 EGFR基因5个SNP位点在AC组、SCC组和对照组相关性的遗传模型分析 [n（%）]

Table 6. The inheritance analysis of five SNPs among AC，SCC and control groups [n（%）]

SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组				SCC组vs对照组
SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	OR （95% CI）	P	AIC	BIC	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs1140475	共显性	C/C	471 （89.5）	238 （90.8）	130 （89.7）	1	0.19	1004.9	1018.9	1	1	706.4	719.9
		C/T	51 （9.7）	24 （9.2）	14 （9.7）	0.93 （0.56～1.55）				0.99 （0.53～1.85）
		T/T	4 （0.8）	0 （0.0）	1 （0.7）	0.00				0.91 （0.10～8.17）
	显性	C/C	471 （89.5）	238 （90.8）	130 （89.7）	1	0.57	1005.9	1015.2	1	0.97	704.4	713.4
		C/T-T/T	55 （10.5）	24 （9.2）	15 （10.3）	0.86 （0.52～1.43）	0.57	1005.9	1015.2	0.99 （0.54～1.81）	0.97	704.4	713.4
	隐性	C/C-C/T	522 （99.2）	262 （100.0）	144 （99.3）	1	0.07	1003	1012.3	1	0.93	704.4	713.4
		T/T	4 （0.8）	0 （0.0）	1 （0.7）	0.00	0.07	1003	1012.3	0.91 （0.10～8.17）	0.93	704.4	713.4
	超显性	C/C-T/T	475 （90.3）	238 （90.8）	131 （90.3）	1	0.81	1006.2	1015.5	1	0.99	704.4	713.4
		C/T	51 （9.7）	24 （9.2）	14 （9.7）	0.94 （0.56～1.56）	0.81	1006.2	1015.5	1.00 （0.53～1.85）	0.99	704.4	713.4
	逻辑累加	---	---	---	---	0.82 （0.51～1.31）	0.39	1005.5	1014.8	0.98 （0.57～1.70）	0.95	704.4	713.4
rs2293347	共显性	C/C	266 （50.5）	150 （57.2）	80 （55.2）	1	0.1	1003.7	1017.7	1	0.55	705.2	718.7
		C/T	226 （43.0）	92 （35.1）	55 （37.9）	0.72 （0.53～0.99）				0.81 （0.55～1.19）
		T/T	34 （6.5）	20 （7.6）	10 （6.9）	1.04 （0.58～1.88）				0.98 （0.46～2.07）
	显性	C/C	266 （50.6）	150 （57.2）	80 （55.2）	1	0.08	1003.1	1012.4	1	0.33	703.5	712.5
		C/T-T/T	260 （49.4）	112 （42.8）	65 （44.8）	0.76 （0.57～1.03）	0.08	1003.1	1012.4	0.83 （0.57～1.20）	0.33	703.5	712.5
	隐性	C/C-C/T	492 （93.5）	242 （92.4）	135 （93.1）	1	0.54	1005.9	1015.2	1	0.85	704.4	713.4
		T/T	34 （6.5）	20 （7.6）	10 （6.9）	1.20 （0.67～2.12）	0.54	1005.9	1015.2	1.07 （0.52～2.23）	0.85	704.4	713.4
	超显性	C/C-T/T	300 （57.0）	170 （64.9）	90 （62.1）	1	0.03	1001.7	1011	1	0.27	703.2	712.2
		C/T	226 （43.0）	92 （35.1）	55 （37.9）	0.72 （0.53～0.98）	0.03	1001.7	1011	0.81 （0.56～1.18）	0.27	703.2	712.2
	逻辑累加	---	---	---	---	0.87 （0.68～1.10）	0.24	1004.8	1014.2	0.89 （0.66～1.21）	0.47	703.9	712.9
^*P < 0.01 （Bonferroni 校正，n = 5）。

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3. 讨论

EGFR基因相关的多态性变异影响各种酶的表达或活性，从而深度参与到癌症的发展过程^[15−16]。目前已有多个EGFR基因中的SNP位点被报道与多种疾病相关^[17−20]。本研究分别收集NSCLC患病者及健康对照者，选取EGFR基因中的5个tagSNPs位点（rs1050171、rs2072454、rs2227983、rs1140475和rs2293347）进行基因分型，并分析了两组中等位基因和基因型频率分布的差异。此外，针对不同病理类型的患者进行了分层分析，探讨了EGFR基因的遗传多态性与云南汉族人群NSCLC发生风险的相关性。结果发现rs2072454与NSCLC和SCC发生风险相关，C等位基因在NSCLC、SCC组中的频率低于对照组，CC基因型在NSCLC、SCC组中的频率低于对照组；rs1050171与NSCLC的病理类型AC发生风险具有相关性，A在AC组中的频率高于对照组，AA在AC组中的频率高于对照组。

本研究中，rs2072454的基因型分布在两组间差异的P值为0.01，达到经Bonferroni校正后达到统计学阈值的边界，该差异未被认为具有统计学意义，等位基因频率分布差异同样在经多重检验校正后失去统计学意义，该信息可能需要谨慎评估。例如，当SNP位点间存在连锁不平衡时，独立检验次数可能被高估，Bonferroni校正可能过度严格，从而导致假阴性风险增加，提示可以通过进一步扩大样本量或独立队列验证，以确认rs2072454与NSCLC的关联性。此外遗传模型分析显示，rs2072454位点的C/T-T/T相对于C/C可能是NSCLC的风险因素，该位点与SCC的发病风险相关，但与AC的发病风险无相关性。之前的研究与笔者的研究结果相一致，例如，2018年，Bashir等^[21]研究发现rs2072454与肺腺癌发生风险具有显著相关性。然而，Choi等^[22]研究表明rs2072454位点与韩国人群中的肺癌发生风险无关。造成研究结果差异的原因有可能是该位点在不同人种或者病理亚型中都可能存在着不一样的作用，将来有必要在其他队列中进行验证。此外，在先前的研究中，在rs2072454位点分析所使用的样本量都较小，例如Bashir等^[21]的病例样本量为130例，Zhang等^[23]的病例样本量为384例。由于目前尚缺乏大样本量的研究，这有可能使统计结果产生偏差，需要扩大样本量进行进一步验证。

本研究结果表明EGFR基因的rs1050171位点与AC发生风险具有相关性，rs2227983位点与SCC的发生风险具有相关性。与本研究结果一致的相关研究包括：Lawi等^[24]研究发现rs1050171 G/A基因型的个体显示可能与NSCLC风险增加有关。此外，Baek等^[25]研究表明rs1050171与韩国人群胶质瘤风险增加同样有关。在其余癌症中，Mustafa等^[26]的研究发现，在叙利亚的大肠癌患者中，rs2227983位点A等位基因的纯合性与该疾病的发生风险有关。2022年，Lawi等^[24]研究表明rs2227983中GG基因型的个体表现出与NSCLC的风险增加有显著和独立的关联。然而，部分研究与本结果存在差异。如在2013年，Wu等^[27]报道rs1050171位点与中国北方人群乙型肝炎病毒相关肝细胞性肝癌无关。Kallel等^[28]发现在突尼斯乳腺癌患者中，rs2227983基因多态性与乳腺发癌率无关，但是在淋巴结转移和高度恶性肿瘤患者中，纯合子GG基因型更为普遍，并且基因型分布与SBR等级I和II和淋巴结转移之间存在显著相关性。综合以上研究可以发现，综上所述，rs1050171和rs2227983在不同类型癌症中的风险关联性rs1050171、rs2227983在不同类型癌症的风险相关性表现出一定的差异，这表明这些基因多态性可能在不同癌症类型中具有不同的作用机制。

本研究没有发现rs1140475和rs2293347位点与NSCLC发生风险的相关性。与本研究结果相似，2016年，Obradović等^[29]发现rs2293347在塞尔维亚人群中与NSCLC无相关性。此外，Zhang等^[23]研究结果中发现rs1140475、rs2293347位点与中国汉族胃癌风险无关。2020年，Saravani等^[30]研究结果发现在伊朗东南部口腔鳞状细胞癌与rs2293347无相关性。然而，2009年，Mason等^[31]研究发现，EGFR中的rs1140475位点与膀胱癌风险增加相关。目前针对这两个位点的研究较少，且不同研究结果并不一致。

基因的遗传多态性受到地域和人群的影响，将来应在更大的样本中进一步验证。癌症的发生是极为复杂的生物学过程，SNP在肿瘤的检测、诊断和治疗等方面发挥了重大的作用，为了进一步探索SNP的功能，将来应针对NSCLC易感性相关的位点进行EGFR基因功能研究，从而阐明这些关键位点在疾病发生和进展中的作用。

图 1 EGFR基因的5个SNP位点测序图

A：rs1050171测序峰图；B：rs2072454测序峰图；C：rs2227983测序峰图；D：rs1140475测序峰图；E：rs2293347测序峰图。

Figure 1. Sequencing of 5 SNPs in EGFR gene

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表 1 EGFR基因5个SNP位点在NSCLC组和对照组间基因型频率分布 [n（%）]

Table 1. Genotype frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene between the NSCLC group and the control group [n（%）]

SNPs	基因型	对照组	NSCLC组	χ²	P	HWE，P
rs1050171	AA	15 （2.9）	24 （5.9）	5.575	0.062	0.985
	AG	148 （28.1）	117 （28.7）
	GG	363 （69.0）	266 （65.4）
rs2072454	CC	214 （40.7）	128 （31.4）	9.118	0.01	0.999
	CT	243 （46.2）	225 （55.3）
	TT	69 （13.1）	54 （13.3）
rs2227983	AA	155 （29.5）	98 （24.1）	3.628	0.163	0.919
	AG	260 （49.4）	222 （54.5）
	GG	111 （21.1）	87 （21.4）
rs1140475	CC	471 （89.5）	368 （90.4）	1.185	0.553	0.053
	CT	51 （9.7）	38 （9.3）
	TT	4 （0.8）	1 （0.2）
rs2293347	CC	266 （50.6）	230 （56.5）	4.49	0.106	0.125
	CT	226 （43.0）	147 （36.1）
	TT	34 （6.5）	30 （7.4）
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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表 2 EGFR基因5个SNP位点在NSCLC组和对照组间等位基因频率分布 [n（%）]

Table 2. Allele frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene between the NSCLC group and the control group [n（%）]

SNPs	等位基因	对照组	NSCLC组	OR （95% CI）	χ²	P
rs1050171	A	178 （16.9）	165 （20.3）	1.25 （0.99～1.58）	3.433	0.064
	G	874 （83.1）	649 （79.7）	1.25 （0.99～1.58）	3.433	0.064
rs2072454	C	671 （63.8）	481 （59.1）	0.82 （0.68～0.99）	4.277	0.039
	T	381 （36.2）	333 （40.9）	0.82 （0.68～0.99）	4.277	0.039
rs2227983	A	570 （54.2）	418 （51.4）	0.89 （0.74～1.07）	1.476	0.224
	G	482 （45.8）	396 （48.6）	0.89 （0.74～1.07）	1.476
rs1140475	C	993 （94.4）	774 （95.1）	1.15 （0.76～1.74）	0.44	0.507
	T	59 （5.6）	40 （4.9）	1.15 （0.76～1.74）	0.44
rs2293347	C	758 （72.1）	607 （74.6）	1.14 （0.92～1.40）	1.48	0.224
	T	294 （27.9）	207 （25.4）	1.14 （0.92～1.40）	1.48
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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表 3 EGFR基因5个SNP位点在NSCLC组和对照组相关性的遗传模型分析 [n（%）]

Table 3. The inheritance analysis of five SNPs between NSCLC and control group [n（%）]

SNPs	遗传模型	基因型	对照组	NSCLC组	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs1050171	共显性	G/G	363 （69.0）	266 （65.4）	1	0.06	1278.7	1293.2
		A/G	148 （28.1）	117 （28.7）	1.08 （0.81～1.44）
		A/A	15 （2.9）	24 （5.9）	2.18 （1.12～4.24）
	显性	G/G	363 （69.0）	266 （65.4）	1	0.24	1280.8	1290.5
		A/G-A/A	163 （31.0）	141 （34.6）	1.18 （0.90～1.55）	0.24	1280.8	1290.5
	隐性	G/G-A/G	511 （97.2）	383 （94.1）	1	0.02	1276.9	1286.6
		A/A	15 （2.8）	24 （5.9）	2.13 （1.10～4.12）	0.02	1276.9	1286.6
	超显性	G/G-A/A	378 （71.9）	290 （71.2）	1	0.84	1282.2	1291.8
		A/G	148 （28.1）	117 （28.8）	1.03 （0.77～1.37）	0.84	1282.2	1291.8
	逻辑累加	---	---	---	1.23 （0.98～1.55）	0.07	1278.9	1288.6
rs2072454	共显性	C/C	214 （40.7）	128 （31.4）	1	0.01	1275	1289.5
		C/T	243 （46.2）	225 （55.3）	1.55 （1.16～2.06）
		T/T	69 （13.1）	54 （13.3）	1.31 （0.86～1.99）
	显性	C/C	214 （40.7）	128 （31.4）	1	0.004^*	1273.7	1283.4
		C/T-T/T	312 （59.3）	279 （68.6）	1.50 （1.14～1.96）	0.004^*	1273.7	1283.4
	隐性	C/C-C/T	457 （86.9）	353 （86.7）	1	0.95	1282.2	1291.9
		T/T	69 （13.1）	54 （13.3）	1.01 （0.69～1.48）	0.95	1282.2	1291.9
	超显性	C/C-T/T	283 （53.8）	182 （44.7）	1	0.006^*	1274.6	1284.3
		C/T	243 （46.2）	225 （55.3）	1.44 （1.11～1.87）	0.006^*	1274.6	1284.3
	逻辑累加	---	---	---	1.24 （1.02～1.50）	0.03	1277.6	1287.3
rs2227983	共显性	A/A	155 （29.5）	98 （24.1）	1	0.16	1280.5	1295.1
		A/G	260 （49.4）	222 （54.5）	1.35 （0.99～1.84）
		G/G	111 （21.1）	87 （21.4）	1.24 （0.85～1.81）
	显性	A/A	155 （29.5）	98 （24.1）	1	0.07	1278.8	1288.5
		A/G-G/G	371 （70.5）	309 （75.9）	1.32 （0.98～1.77）	0.07	1278.8	1288.5
	隐性	A/A-A/G	415 （78.9）	320 （78.6）	1	0.92	1282.2	1291.9
		G/G	111 （21.1）	87 （21.4）	1.02 （0.74～1.39）	0.92	1282.2	1291.9
	超显性	A/A-G/G	266 （50.6）	185 （45.5）	1	0.12	1279.8	1289.5
		A/G	260 （49.4）	222 （54.5）	1.23 （0.95～1.59）	0.12	1279.8	1289.5
	逻辑累加	---	---	---	1.13 （0.93～1.36）	0.22	1280.7	1290.3
rs1140475	共显性	C/C	471 （89.5）	368 （90.4）	1	0.52	1282.9	1297.4
		C/T	51 （9.7）	38 （9.4）	0.95 （0.61～1.48）
		T/T	4 （0.8）	1 （0.2）	0.32 （0.04～2.87）
	显性	C/C	471 （89.5）	368 （90.4）	1	0.66	1282	1291.7
		C/T-T/T	55 （10.5）	39 （9.6）	0.91 （0.59～1.40）	0.66	1282	1291.7
	隐性	C/C-C/T	522 （99.2）	406 （99.8）	1	0.26	1280.9	1290.6
		T/T	4 （0.8）	1 （0.2）	0.32 （0.04～2.88）	0.26	1280.9	1290.6
	超显性	C/C-T/T	475 （90.3）	369 （90.7）	1	0.85	1282.2	1291.8
		C/T	51 （9.7）	38 （9.3）	0.96 （0.62～1.49）	0.85	1282.2	1291.8
	逻辑累加	---	---	---	0.88 （0.59～1.31）	0.52	1281.8	1291.4
rs2293347	共显性	C/C	266 （50.5）	230 （56.5）	1	0.11	1279.7	1294.2
		C/T	226 （43.0）	147 （36.1）	0.75 （0.57～0.99）
		T/T	34 （6.5）	30 （7.4）	1.02 （0.61～1.72）
	显性	C/C	266 （50.6）	230 （56.5）	1	0.07	1278.9	1288.6
		C/T-T/T	260 （49.4）	177 （43.5）	0.79 （0.61～1.02）	0.07	1278.9	1288.6
	隐性	C/C-C/T	492 （93.5）	377 （92.6）	1	0.59	1281.9	1291.6
		T/T	34 （6.5）	30 （7.4）	1.15 （0.69～1.92）	0.59	1281.9	1291.6
	超显性	C/C-T/T	300 （57.0）	260 （63.9）	1	0.03	1277.7	1287.4
		C/T	226 （43.0）	147 （36.1）	0.75 （0.58～0.98）	0.03	1277.7	1287.4
	逻辑累加	---	---	---	0.88 （0.71～1.08）	0.22	1280.7	1290.4
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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表 4 EGFR基因中5个SNP位点在AC组、SCC组和对照组间基因型频率分布 [n（%）]

Table 4. Genotype frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene among AC，SCC and control groups [n（%）]

SNPs	基因型	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组		SCC组vs对照组
SNPs	基因型	对照组	AC组	SCC组	χ²	P	χ²	P
rs1050171	AA	15 （2.9）	19 （7.3）	5 （3.4）	8.483	0.014	0.197	0.906
	AG	148 （28.1）	75 （28.6）	42 （29.0）
	GG	363 （69.0）	168 （64.1）	98 （67.6）
rs2072454	CC	214 （40.7）	89 （34.0）	39 （26.9）	3.749	0.153	9.756	0.008^*
	CT	243 （46.2）	139 （53.1）	86 （59.3）
	TT	69 （13.1）	34 （13.0）	20 （13.8）
rs2227983	AA	155 （29.5）	71 （27.1）	27 （18.6）	0.491	0.782	8.117	0.017
	AG	260 （49.4）	133 （50.8）	89 （61.4）
	GG	111 （21.1）	58 （22.1）	29 （20.0）
rs1140475	CC	471 （89.5）	238 （90.8）	130 （89.6）	2.077	0.354	0.008	0.996
	CT	51 （9.7）	24 （9.2）	14 （9.7）
	TT	4 （0.8）	0 （0.0）	1 （0.7）
rs2293347	CC	266 （50.5）	150 （57.3）	80 （55.2）	4.499	0.106	1.187	0.552
	CT	226 （43.0）	92 （35.1）	55 （37.9）
	TT	34 （6.5）	20 （7.6）	10 （6.9）
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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表 5 EGFR基因5个SNP位点在在AC组、SCC组和对照组间等位基因频率分布 [n（%）]

Table 5. Allele frequency distribution of 5 SNPs in EGFR gene among the AC group，SCC group，and control group [n（%）]

SNPs	等位基因	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组			SCC组vs对照组
SNPs	等位基因	对照组	AC组	SCC组	χ²	P	OR （95% CI）	χ²	P	OR （95% CI）
rs1050171	A	178 （16.9）	113 （21.6）	52 （17.9）	0.025	1.35 （1.04～1.76）		0.164	0.686	1.07 （0.76～1.51）
	G	874 （83.1）	411 （78.4）	238 （82.1）	0.025	1.35 （1.04～1.76）		0.164	0.686	1.07 （0.76～1.51）
rs2072454	C	671 （63.8）	317 （60.5）	164 （56.6）	0.204	0.87 （0.70～1.08）		5.057	0.025	0.74 （0.57～0.96）
	T	381 （36.2）	207 （39.5）	126 （43.4）	0.204	0.87 （0.70～1.08）		5.057	0.025	0.74 （0.57～0.96）
rs2227983	A	570 （54.2）	275 （52.5）	143 （49.3）	0.523	0.93 （0.76～1.15）		2.167	0.141	0.82 （0.63～1.07）
	G	482 （45.8）	249 （47.5）	147 （50.7）	0.523	0.93 （0.76～1.15）		2.167	0.141	0.82 （0.63～1.07）
rs1140475	C	993 （94.4）	500 （95.4）	274 （94.5）	0.389	1.24 （0.76～2.01）		0.004	0.952	1.02 （0.58～1.80）
	T	59 （5.6）	24 （4.6）	16 （5.5）	0.389	1.24 （0.76～2.01）		0.004	0.952	1.02 （0.58～1.80）
rs2293347	C	758 （72.1）	392 （74.8）	215 （74.1）	0.246	1.15 （0.91～1.46）		0.495	0.481	1.11 （0.83～1.50）
rs2293347	T	294 （27.9）	132 （25.2）	75 （25.9）	0.246	1.15 （0.91～1.46）		0.495	0.481	1.11 （0.83～1.50）
^*P < 0.01（Bonferroni校正，n = 5）。

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表 6 EGFR基因5个SNP位点在AC组、SCC组和对照组相关性的遗传模型分析 [n（%）]

Table 6. The inheritance analysis of five SNPs among AC，SCC and control groups [n（%）]

SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组				SCC组vs对照组
SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	OR （95% CI）	P	AIC	BIC	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs1050171	共显性	G/G	363 （69.0）	168 （64.1）	98 （67.5）	1	0.02	1000.3	1014.3	1	0.91	706.2	719.8
		A/G	148 （28.1）	75 （28.6）	42 （29.0）	1.09 （0.79～1.53）				1.05 （0.70～1.58）
		A/A	15 （2.8）	19 （7.3）	5 （3.5）	2.74 （1.36～5.52）				1.23 （0.44～3.48）
	显性	G/G	363 （69.0）	168 （64.1）	98 （67.6）	1	0.17	1004.3	1013.7	1	0.74	704.3	713.3
		A/G-A/A	163 （31.0）	94 （35.9）	47 （32.4）	1.25 （0.91～1.70）	0.17	1004.3	1013.7	1.07 （0.72～1.58）	0.74	704.3	713.3
	隐性	G/G-A/G	511 （97.2）	243 （92.8）	140 （96.5）	1	0.006^*	998.6	1007.9	1	0.71	704.3	713.3
		A/A	15 （2.8）	19 （7.2）	5 （3.5）	2.66 （1.33～5.33）	0.006^*	998.6	1007.9	1.22 （0.43～3.41）	0.71	704.3	713.3
	超显性	G/G-A/A	378 （71.9）	187 （71.4）	103 （71.0）	1	0.89	1006.2	1015.5	1	0.84	704.4	713.4
		A/G	148 （28.1）	75 （28.6）	42 （29.0）	1.02 （0.74～1.42）	0.89	1006.2	1015.5	1.04 （0.69～1.56）	0.84	704.4	713.4
	逻辑累加	---	---	---	---	1.33 （1.03～1.72）	0.03	1001.6	1010.9	1.07 （0.76～1.51）	0.69	704.3	713.3
rs2072454	共显性	C/C	214 （40.7）	89 （34.0）	39 （26.9）	1	0.15	1004.5	1018.5	1	0.006^*	696.4	709.9
		C/T	243 （46.2）	139 （53.0）	86 （59.3）	1.38 （1.00～1.90）				1.94 （1.28～2.96）
		T/T	69 （13.1）	34 （13.0）	20 （13.8）	1.18 （0.73～1.91）				1.59 （0.87～2.91）
	显性	C/C	214 （40.7）	89 （34.0）	39 （26.9）	1	0.07	1002.9	1012.2	1	0.002^*	694.9	703.9
		C/T-T/T	312 （59.3）	173 （66.0）	106 （73.1）	1.33 （0.98～1.82）	0.07	1002.9	1012.2	1.86 （1.24～2.80）	0.002^*	694.9	703.9
	隐性	C/C-C/T	457 （86.9）	228 （87.0）	125 （86.2）	1	0.96	1006.2	1015.6	1	0.83	704.4	713.4
		T/T	69 （13.1）	34 （13.0）	20 （13.8）	0.99 （0.64～1.53）	0.96	1006.2	1015.6	1.06 （0.62～1.81）	0.83	704.4	713.4
	超显性	C/C-T/T	283 （53.8）	123 （47.0）	59 （40.7）	1	0.07	1002.9	1012.3	1	0.005^*	696.6	705.6
		C/T	243 （46.2）	139 （53.0）	86 （59.3）	1.32 （0.98～1.77）	0.07	1002.9	1012.3	1.70 （1.17～2.47）	0.005^*	696.6	705.6
	逻辑累加	---	---	---	---	1.16 （0.93～1.44）	0.2	1004.5	1013.9	1.37 （1.05～1.80）	0.02	699.2	708.2
rs2227983	共显性	A/A	155 （29.5）	71 （27.1）	27 （18.6）	1	0.78	1007.7	1021.7	1	0.02	698	711.5
		A/G	260 （49.4）	133 （50.8）	89 （61.4）	1.12 （0.79～1.58）				1.97 （1.22～3.16）
		G/G	111 （21.1）	58 （22.1）	29 （20.0）	1.14 （0.75～1.74）				1.50 （0.84～2.67）
	显性	A/A	155 （29.5）	71 （27.1）	27 （18.6）	1	0.49	1005.7	1015.1	1	0.007	697.2	706.3
		A/G-G/G	371 （70.5）	191 （72.9）	118 （81.4）	1.12 （0.81～1.56）	0.49	1005.7	1015.1	1.83 （1.15～2.89）	0.007	697.2	706.3
	隐性	A/A-A/G	415 （78.9）	204 （77.9）	116 （80.0）	1	0.74	1006.1	1015.4	1	0.77	704.3	713.4
		G/G	111 （21.1）	58 （22.1）	29 （20.0）	1.06 （0.74～1.52）	0.74	1006.1	1015.4	0.93 （0.59～1.48）	0.77	704.3	713.4
	超显性	A/A-G/G	266 （50.6）	129 （49.2）	56 （38.6）	1	0.72	1006.1	1015.4	1	0.01	697.9	706.9
		A/G	260 （49.4）	133 （50.8）	89 （61.4）	1.05 （0.78～1.42）	0.72	1006.1	1015.4	1.63 （1.12～2.37）	0.01	697.9	706.9
	逻辑累加	---	---	---	---	1.07 （0.87～1.32）	0.52	1005.8	1015.2	1.23 （0.94～1.60）	0.13	702.2	711.2

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表 6 EGFR基因5个SNP位点在AC组、SCC组和对照组相关性的遗传模型分析 [n（%）]

Table 6. The inheritance analysis of five SNPs among AC，SCC and control groups [n（%）]

SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	AC组vs对照组				SCC组vs对照组
SNPs	遗传模型	基因型	对照组	AC组	SCC组	OR （95% CI）	P	AIC	BIC	OR （95% CI）	P	AIC	BIC
rs1140475	共显性	C/C	471 （89.5）	238 （90.8）	130 （89.7）	1	0.19	1004.9	1018.9	1	1	706.4	719.9
		C/T	51 （9.7）	24 （9.2）	14 （9.7）	0.93 （0.56～1.55）				0.99 （0.53～1.85）
		T/T	4 （0.8）	0 （0.0）	1 （0.7）	0.00				0.91 （0.10～8.17）
	显性	C/C	471 （89.5）	238 （90.8）	130 （89.7）	1	0.57	1005.9	1015.2	1	0.97	704.4	713.4
		C/T-T/T	55 （10.5）	24 （9.2）	15 （10.3）	0.86 （0.52～1.43）	0.57	1005.9	1015.2	0.99 （0.54～1.81）	0.97	704.4	713.4
	隐性	C/C-C/T	522 （99.2）	262 （100.0）	144 （99.3）	1	0.07	1003	1012.3	1	0.93	704.4	713.4
		T/T	4 （0.8）	0 （0.0）	1 （0.7）	0.00	0.07	1003	1012.3	0.91 （0.10～8.17）	0.93	704.4	713.4
	超显性	C/C-T/T	475 （90.3）	238 （90.8）	131 （90.3）	1	0.81	1006.2	1015.5	1	0.99	704.4	713.4
		C/T	51 （9.7）	24 （9.2）	14 （9.7）	0.94 （0.56～1.56）	0.81	1006.2	1015.5	1.00 （0.53～1.85）	0.99	704.4	713.4
	逻辑累加	---	---	---	---	0.82 （0.51～1.31）	0.39	1005.5	1014.8	0.98 （0.57～1.70）	0.95	704.4	713.4
rs2293347	共显性	C/C	266 （50.5）	150 （57.2）	80 （55.2）	1	0.1	1003.7	1017.7	1	0.55	705.2	718.7
		C/T	226 （43.0）	92 （35.1）	55 （37.9）	0.72 （0.53～0.99）				0.81 （0.55～1.19）
		T/T	34 （6.5）	20 （7.6）	10 （6.9）	1.04 （0.58～1.88）				0.98 （0.46～2.07）
	显性	C/C	266 （50.6）	150 （57.2）	80 （55.2）	1	0.08	1003.1	1012.4	1	0.33	703.5	712.5
		C/T-T/T	260 （49.4）	112 （42.8）	65 （44.8）	0.76 （0.57～1.03）	0.08	1003.1	1012.4	0.83 （0.57～1.20）	0.33	703.5	712.5
	隐性	C/C-C/T	492 （93.5）	242 （92.4）	135 （93.1）	1	0.54	1005.9	1015.2	1	0.85	704.4	713.4
		T/T	34 （6.5）	20 （7.6）	10 （6.9）	1.20 （0.67～2.12）	0.54	1005.9	1015.2	1.07 （0.52～2.23）	0.85	704.4	713.4
	超显性	C/C-T/T	300 （57.0）	170 （64.9）	90 （62.1）	1	0.03	1001.7	1011	1	0.27	703.2	712.2
		C/T	226 （43.0）	92 （35.1）	55 （37.9）	0.72 （0.53～0.98）	0.03	1001.7	1011	0.81 （0.56～1.18）	0.27	703.2	712.2
	逻辑累加	---	---	---	---	0.87 （0.68～1.10）	0.24	1004.8	1014.2	0.89 （0.66～1.21）	0.47	703.9	712.9
^*P < 0.01 （Bonferroni 校正，n = 5）。

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参考文献(31)

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1. 材料与方法
1.1 研究对象
1.2 基因组DNA提取
1.3 基因分型
1.4 统计学分析
2. 结果
2.1 研究对象
2.2 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC的相关性
2.3 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC相关性的遗传模型分析
2.4 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC病理类型的相关性
2.5 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC病理类型相关性的遗传模型分析
3. 讨论

1. 材料与方法
1.1 研究对象
1.2 基因组DNA提取
1.3 基因分型
1.4 统计学分析
2. 结果
2.1 研究对象
2.2 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC的相关性
2.3 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC相关性的遗传模型分析
2.4 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC病理类型的相关性
2.5 EGFR基因的5个SNP位点与NSCLC病理类型相关性的遗传模型分析
3. 讨论

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EGFR基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌的关联性

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